49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0846 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 1216 aa  2475    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1107  phage tape measure protein  23.68 
 
 		 1276 aa  185  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  37.2 
 
 		 2066 aa  120  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  37.2 
 
 		 2066 aa  120  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  23.38 
 
 		 1510 aa  101  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  23.38 
 
 		 1510 aa  101  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2094  SLT domain-containing protein  24.38 
 
 		 1566 aa  99.4  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  29.44 
 
 		 1137 aa  93.2  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0848  peptidase M23B  45.87 
 
 		 743 aa  92.8  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30070  transglycosylase family protein  50 
 
 		 278 aa  80.1  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.398467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4936  Lytic transglycosylase catalytic  52.17 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38120  transglycosylase family protein  45.71 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  56.67 
 
 		 304 aa  77.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3416  prophage LambdaBa01, membrane protein, putative  27.67 
 
 		 725 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  21.3 
 
 		 907 aa  68.6  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0731  Lytic transglycosylase catalytic  53.7 
 
 		 289 aa  67.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860163  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  23.11 
 
 		 759 aa  66.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  22.36 
 
 		 1084 aa  66.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8106  SLT domain protein-like protein  48.44 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  27.18 
 
 		 811 aa  65.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  27.18 
 
 		 811 aa  65.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  27.18 
 
 		 726 aa  65.1  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  25.79 
 
 		 911 aa  63.5  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1263  phage tape measure protein  19.85 
 
 		 852 aa  63.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00378287  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1637  SLT domain-containing protein  28.18 
 
 		 1736 aa  60.8  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0364  hypothetical protein  21.7 
 
 		 989 aa  60.1  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0355  Phage-related protein-like protein  21.7 
 
 		 989 aa  60.1  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2688  phage protein  25.47 
 
 		 721 aa  60.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1146  minor tail protein gp26-like protein  21.63 
 
 		 874 aa  55.5  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.668706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  25.15 
 
 		 716 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5589  hypothetical protein  51.92 
 
 		 376 aa  54.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  37.08 
 
 		 767 aa  53.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13931  hypothetical protein  49.18 
 
 		 302 aa  52.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0880778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  24.24 
 
 		 1297 aa  52  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3581  TMP repeat-containing protein  23.53 
 
 		 1206 aa  51.6  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0454  prophage LambdaBa04, tape measure protein  23.7 
 
 		 1311 aa  51.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0477  prophage LambdaBa04, tape measure protein  23.7 
 
 		 1311 aa  51.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  29.13 
 
 		 590 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.23 
 
 		 805 aa  50.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0549  TP901 family phage tail tape measure protein  20.69 
 
 		 1347 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321201  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0901  Phage-related protein-like protein  19.61 
 
 		 1155 aa  47.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0919  phage tape measure protein  19.61 
 
 		 1155 aa  47.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1369  TP901 family phage tail tape measure protein  20.69 
 
 		 1347 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.275102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2837  hypothetical protein  55 
 
 		 1149 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00780437  hitchhiker  0.000194456 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1763  minor tail protein gp26-like protein  22.86 
 
 		 737 aa  47  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.581753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0287  hypothetical protein  36.23 
 
 		 565 aa  45.8  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00035869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  25.47 
 
 		 1216 aa  45.1  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0849  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.81 
 
 		 738 aa  45.1  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000280434  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0533  Phage-related protein-like protein  18.85 
 
 		 1077 aa  45.1  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.132242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>