39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0364 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0364  hypothetical protein  100 
 
 
989 aa  1972    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0355  Phage-related protein-like protein  100 
 
 
989 aa  1972    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0919  phage tape measure protein  34.84 
 
 
1155 aa  547  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0901  Phage-related protein-like protein  34.84 
 
 
1155 aa  547  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  23.78 
 
 
726 aa  93.6  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  24.5 
 
 
1137 aa  90.9  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3497  prophage LambdaBa01, membrane protein  24.74 
 
 
811 aa  90.1  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.797646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3774  prophage LambdaBa01, membrane protein  24.74 
 
 
811 aa  90.1  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2046  TP901 family phage tail tape measure protein  22.43 
 
 
1510 aa  86.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2010  TP901 family phage tail tape measure protein  22.43 
 
 
1510 aa  86.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  22.51 
 
 
1995 aa  85.1  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1709  Phage-related protein-like protein  24.01 
 
 
759 aa  83.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3416  prophage LambdaBa01, membrane protein, putative  22.25 
 
 
725 aa  82  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1146  minor tail protein gp26-like protein  22.11 
 
 
874 aa  75.5  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.668706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  20.63 
 
 
716 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1078  TP901 family tail tape measure protein  24.38 
 
 
907 aa  72.4  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0533  Phage-related protein-like protein  20.91 
 
 
1077 aa  69.7  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.132242  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2636  phage tail tape measure protein, TP901 family  21.63 
 
 
805 aa  69.7  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2320  phage tape measure protein  23.17 
 
 
792 aa  67.4  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.722724  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0588  phage tape measure protein  25.45 
 
 
959 aa  65.9  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.739984  normal  0.209865 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  24.33 
 
 
1297 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  24.12 
 
 
911 aa  63.9  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2935  TP901 family phage tail tape measure protein  24.46 
 
 
975 aa  62.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0846  lytic transglycosylase, catalytic  21.59 
 
 
1216 aa  60.5  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15470  hypothetical protein  26.7 
 
 
807 aa  60.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1618  hypothetical protein  24.7 
 
 
762 aa  59.3  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3481  Lytic transglycosylase catalytic  22.09 
 
 
767 aa  58.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0132558  hitchhiker  0.0026224 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5849  hypothetical protein  21.3 
 
 
786 aa  55.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1763  minor tail protein gp26-like protein  18.53 
 
 
737 aa  54.3  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.581753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1263  phage tape measure protein  24.28 
 
 
852 aa  50.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00378287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0549  TP901 family phage tail tape measure protein  20.4 
 
 
1347 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1369  TP901 family phage tail tape measure protein  21.58 
 
 
1347 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.275102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0454  prophage LambdaBa04, tape measure protein  21.58 
 
 
1311 aa  49.3  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0477  prophage LambdaBa04, tape measure protein  21.58 
 
 
1311 aa  49.3  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4235  hypothetical protein  20.17 
 
 
1089 aa  47.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1576  TP901 family phage tail tape measure protein  19.21 
 
 
1084 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.929856  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0903  Chromosome segregation ATPase-like protein  22.96 
 
 
1022 aa  47  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2688  phage protein  22.88 
 
 
721 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0550  TP901 family phage tail tape measure protein  22.49 
 
 
969 aa  44.7  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>