19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0682 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0619  minor tail protein gp26-like  100 
 
 		 1136 aa  2165    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0682  minor tail protein gp26-like  100 
 
 		 1136 aa  2165    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.830356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0901  Phage-related protein-like protein  35.26 
 
 		 1155 aa  75.5  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0919  phage tape measure protein  35.26 
 
 		 1155 aa  75.5  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1847  hypothetical protein  37.96 
 
 		 877 aa  67  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202456 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  24.63 
 
 		 1137 aa  67  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  43.18 
 
 		 956 aa  58.5  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  27.74 
 
 		 919 aa  57.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  26.9 
 
 		 920 aa  56.6  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2400  phage protein  30.08 
 
 		 1297 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0671  TMP repeat protein  25.25 
 
 		 871 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5849  hypothetical protein  32.22 
 
 		 786 aa  52.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4235  hypothetical protein  32.41 
 
 		 1089 aa  51.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4374  phage tail tape measure protein, family, core region  30.22 
 
 		 1549 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6196  phage tail protein  31.85 
 
 		 759 aa  50.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0409  hypothetical protein  24.4 
 
 		 806 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  44.12 
 
 		 887 aa  50.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  28.3 
 
 		 731 aa  49.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0588  phage tape measure protein  22.36 
 
 		 959 aa  47.8  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.739984  normal  0.209865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>