14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1643 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1643  hypothetical protein  100 
 
 		 824 aa  1626    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.304557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2485  hypothetical protein  38.85 
 
 		 851 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.652813  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7153  prophage tail length tape measure  27.51 
 
 		 913 aa  104  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553544 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0537  hypothetical protein  39.46 
 
 		 792 aa  86.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.216857 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3387  hypothetical protein  25.37 
 
 		 715 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000202252 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2689  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1056 aa  62.4  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3962  hypothetical protein  26.18 
 
 		 671 aa  62  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.443491 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1230  hypothetical protein  40.26 
 
 		 726 aa  51.6  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.909152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1636  lambda family phage tail tape measure protein  29.1 
 
 		 1668 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2736  hypothetical protein  24.77 
 
 		 756 aa  47.8  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3161  hypothetical protein  31.01 
 
 		 828 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0657  gp21  38.89 
 
 		 1056 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7316  hypothetical protein  35.43 
 
 		 674 aa  46.6  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198357  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2059  phage tail tape measure protein  28.36 
 
 		 1673 aa  46.2  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>