30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2689 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2689  hypothetical protein  100 
 
 
1056 aa  2126    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5328  phage tape measure protein  42.64 
 
 
837 aa  144  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227887  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3289  phage tape measure protein  42.64 
 
 
838 aa  144  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.4409 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1643  phage tape measure protein  41.36 
 
 
938 aa  131  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1331  hypothetical protein  34.17 
 
 
1655 aa  116  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3444  phage tape measure protein  32.54 
 
 
904 aa  86.3  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144492  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1404  hypothetical protein  27.03 
 
 
710 aa  79.7  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  29.41 
 
 
957 aa  71.2  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  35.1 
 
 
1644 aa  64.7  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1889  hypothetical protein  28.05 
 
 
1006 aa  62.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.405118  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0274  hypothetical protein  28.81 
 
 
419 aa  60.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  28.17 
 
 
914 aa  58.9  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2485  hypothetical protein  23.58 
 
 
851 aa  57  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.652813  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  33.33 
 
 
1354 aa  55.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  36.9 
 
 
908 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  34.25 
 
 
1021 aa  55.5  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  30.95 
 
 
1366 aa  53.5  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  25.93 
 
 
1380 aa  52.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  28.82 
 
 
1104 aa  52  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1643  hypothetical protein  23.74 
 
 
824 aa  51.2  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.304557  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08240  hypothetical protein  33.6 
 
 
611 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000139555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0780  hypothetical protein  33.33 
 
 
612 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  29.87 
 
 
820 aa  50.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0089  putative phage tail tape measure protein  32.79 
 
 
1521 aa  50.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  25.95 
 
 
1222 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  29.09 
 
 
1161 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  24.91 
 
 
1122 aa  48.9  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  26.1 
 
 
1343 aa  48.9  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22120  hypothetical protein  34.62 
 
 
774 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000849243  unclonable  1.93803e-21 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  24.34 
 
 
1366 aa  44.7  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>