40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2675 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  100 
 
 		 1644 aa  3239    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  35.42 
 
 		 1343 aa  147  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2489  phage tape measure protein  40 
 
 		 1527 aa  140  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  33.75 
 
 		 1318 aa  139  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0280  phage tape measure protein  32.41 
 
 		 530 aa  139  6.0000000000000005e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  35 
 
 		 1366 aa  138  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  34.2 
 
 		 1380 aa  138  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4710  phage tape measure protein  33.75 
 
 		 513 aa  134  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  34.58 
 
 		 1354 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  34.48 
 
 		 1451 aa  130  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  34.11 
 
 		 1366 aa  128  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  31.56 
 
 		 1080 aa  126  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0657  gp21  30.19 
 
 		 1056 aa  125  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011896 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  31.25 
 
 		 915 aa  124  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  30.8 
 
 		 1095 aa  120  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2488  phage tape measure protein  29.86 
 
 		 611 aa  119  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  38.04 
 
 		 1222 aa  118  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  28.02 
 
 		 921 aa  114  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  28.09 
 
 		 668 aa  111  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  30.47 
 
 		 1080 aa  107  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  30.47 
 
 		 1080 aa  107  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  30.47 
 
 		 1080 aa  107  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4099  phage tape measure protein  36.93 
 
 		 1137 aa  105  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2890  phage tape measure protein  36.93 
 
 		 1137 aa  105  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  27.24 
 
 		 671 aa  105  9e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1441  phage tape measure protein  26.94 
 
 		 706 aa  104  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  28.62 
 
 		 1075 aa  103  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1030  bacteriophage tail tape meausure protein  29.15 
 
 		 1282 aa  102  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.519663 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3596  phage tape measure protein  32.86 
 
 		 632 aa  102  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0625908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  30.74 
 
 		 1251 aa  99.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  28.17 
 
 		 991 aa  97.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0788  phage tape measure protein  27.91 
 
 		 866 aa  76.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  31.94 
 
 		 1115 aa  74.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1889  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1006 aa  72  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.405118  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2689  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1056 aa  70.5  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  33.33 
 
 		 760 aa  69.7  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  24.62 
 
 		 1104 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  43.3 
 
 		 820 aa  58.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  54.55 
 
 		 783 aa  55.5  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0274  hypothetical protein  26.92 
 
 		 419 aa  51.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>