38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2670 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  72.57 
 
 		 1366 aa  1863    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  100 
 
 		 1343 aa  2681    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  78.03 
 
 		 1318 aa  2006    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4710  phage tape measure protein  83.6 
 
 		 513 aa  719    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  37.76 
 
 		 1075 aa  192  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  33.65 
 
 		 1095 aa  190  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  41.43 
 
 		 1080 aa  181  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  41.04 
 
 		 1080 aa  173  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  41.04 
 
 		 1080 aa  173  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  41.04 
 
 		 1080 aa  173  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0280  phage tape measure protein  36.89 
 
 		 530 aa  162  6e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1030  bacteriophage tail tape meausure protein  36.69 
 
 		 1282 aa  152  5e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.519663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  36.96 
 
 		 1251 aa  149  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0657  gp21  35.23 
 
 		 1056 aa  145  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011896 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  34.1 
 
 		 1354 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  32.98 
 
 		 1380 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2890  phage tape measure protein  35.56 
 
 		 1137 aa  135  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4099  phage tape measure protein  35.56 
 
 		 1137 aa  135  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  36.79 
 
 		 1644 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  33.18 
 
 		 1366 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2489  phage tape measure protein  41.04 
 
 		 1527 aa  127  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  31.8 
 
 		 915 aa  126  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  33.09 
 
 		 1451 aa  121  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  31 
 
 		 921 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  29.31 
 
 		 991 aa  117  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3596  phage tape measure protein  33.96 
 
 		 632 aa  113  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0625908  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  38.01 
 
 		 1222 aa  112  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  31.28 
 
 		 668 aa  111  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  30.86 
 
 		 671 aa  107  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2488  phage tape measure protein  29.6 
 
 		 611 aa  106  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1441  phage tape measure protein  28.11 
 
 		 706 aa  99  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  27.53 
 
 		 760 aa  85.1  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0788  phage tape measure protein  29.44 
 
 		 866 aa  80.5  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  27.62 
 
 		 1104 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  38.46 
 
 		 924 aa  51.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2477  hypothetical protein  34.83 
 
 		 732 aa  47.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3487  hypothetical protein  25 
 
 		 636 aa  46.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.186472  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  20.62 
 
 		 7659 aa  45.1  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>