37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3197 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  67.47 
 
 		 1366 aa  1685    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  77.8 
 
 		 1343 aa  1997    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4710  phage tape measure protein  92.03 
 
 		 513 aa  784    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  100 
 
 		 1318 aa  2649    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  37.41 
 
 		 1075 aa  191  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  43.36 
 
 		 1080 aa  178  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  31.39 
 
 		 1095 aa  177  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  43.36 
 
 		 1080 aa  172  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  43.36 
 
 		 1080 aa  172  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  43.36 
 
 		 1080 aa  172  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0280  phage tape measure protein  37.78 
 
 		 530 aa  164  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1030  bacteriophage tail tape meausure protein  38.89 
 
 		 1282 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.519663 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0657  gp21  35 
 
 		 1056 aa  146  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  38.68 
 
 		 1251 aa  145  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  35.09 
 
 		 1354 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1366 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4099  phage tape measure protein  35.19 
 
 		 1137 aa  135  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2890  phage tape measure protein  35.19 
 
 		 1137 aa  135  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2489  phage tape measure protein  40.27 
 
 		 1527 aa  133  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  32.01 
 
 		 915 aa  130  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  35.41 
 
 		 1644 aa  127  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3596  phage tape measure protein  36.32 
 
 		 632 aa  122  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0625908  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  35.97 
 
 		 1222 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  33.33 
 
 		 1451 aa  120  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  29.55 
 
 		 921 aa  120  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  34.65 
 
 		 668 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  28.16 
 
 		 991 aa  112  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  34.16 
 
 		 671 aa  110  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2488  phage tape measure protein  28.93 
 
 		 611 aa  107  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1441  phage tape measure protein  30.65 
 
 		 706 aa  101  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  35.54 
 
 		 760 aa  93.2  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  27.62 
 
 		 1104 aa  76.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0788  phage tape measure protein  27.22 
 
 		 866 aa  68.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  32.43 
 
 		 924 aa  54.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3992  hypothetical protein  38.89 
 
 		 738 aa  52.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2477  hypothetical protein  37.33 
 
 		 732 aa  48.5  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  41.82 
 
 		 811 aa  45.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>