20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3992 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3992  hypothetical protein  100 
 
 		 738 aa  1462    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2477  hypothetical protein  53.71 
 
 		 732 aa  761    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  30.07 
 
 		 924 aa  90.1  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  28.84 
 
 		 1127 aa  80.1  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  38.33 
 
 		 811 aa  71.2  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2008  hypothetical protein  26.77 
 
 		 735 aa  70.9  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.904662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2177  hypothetical protein  50 
 
 		 620 aa  69.7  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  26.27 
 
 		 669 aa  66.6  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3346  hypothetical protein  41.54 
 
 		 682 aa  66.6  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.677729  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  48.81 
 
 		 970 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  24.43 
 
 		 936 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7316  hypothetical protein  25.08 
 
 		 674 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1606  hypothetical protein  26.6 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  38.89 
 
 		 1318 aa  52.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  33.33 
 
 		 1380 aa  51.2  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  44.83 
 
 		 1366 aa  49.7  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  44.83 
 
 		 1354 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  39.71 
 
 		 1173 aa  48.9  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1716  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  26.84 
 
 		 924 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.309525  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  37.84 
 
 		 1366 aa  45.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>