36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0280 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0280  phage tape measure protein  100 
 
 		 530 aa  1055    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  39.09 
 
 		 1366 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4710  phage tape measure protein  35.74 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  37.78 
 
 		 1318 aa  164  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  36.89 
 
 		 1343 aa  162  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  40.38 
 
 		 1354 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  39.9 
 
 		 1366 aa  156  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  37.98 
 
 		 1380 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1030  bacteriophage tail tape meausure protein  36.59 
 
 		 1282 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.519663 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4099  phage tape measure protein  39.92 
 
 		 1137 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2890  phage tape measure protein  39.92 
 
 		 1137 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  36.54 
 
 		 1095 aa  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2489  phage tape measure protein  39.22 
 
 		 1527 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0657  gp21  33.75 
 
 		 1056 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011896 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  32.51 
 
 		 1080 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  41.7 
 
 		 1222 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  34.01 
 
 		 1251 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  33.19 
 
 		 1644 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  34.13 
 
 		 1075 aa  127  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  32.92 
 
 		 1080 aa  123  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  32.92 
 
 		 1080 aa  123  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  32.92 
 
 		 1080 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2488  phage tape measure protein  26.55 
 
 		 611 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  28.95 
 
 		 1451 aa  104  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  25.59 
 
 		 991 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3596  phage tape measure protein  30.81 
 
 		 632 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0625908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  27.74 
 
 		 760 aa  98.2  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1441  phage tape measure protein  27.8 
 
 		 706 aa  98.2  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  25.32 
 
 		 668 aa  84  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  27.07 
 
 		 671 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0788  phage tape measure protein  25.99 
 
 		 866 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  25.4 
 
 		 915 aa  70.5  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  23.37 
 
 		 921 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  23.04 
 
 		 1104 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3289  phage tape measure protein  25.64 
 
 		 838 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.4409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5328  phage tape measure protein  25.64 
 
 		 837 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227887  normal  0.0605848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>