36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2489 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2489  phage tape measure protein  100 
 
 		 1527 aa  2990    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  47.74 
 
 		 1380 aa  205  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  48.9 
 
 		 1366 aa  199  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  48.46 
 
 		 1354 aa  197  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  55.02 
 
 		 1222 aa  165  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0280  phage tape measure protein  39.22 
 
 		 530 aa  160  2e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  40.18 
 
 		 1318 aa  158  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  40.93 
 
 		 1343 aa  153  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  40.47 
 
 		 1366 aa  151  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  39.81 
 
 		 1644 aa  146  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4710  phage tape measure protein  38.14 
 
 		 513 aa  145  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  28.91 
 
 		 1080 aa  129  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  28.48 
 
 		 1095 aa  127  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  37.67 
 
 		 1451 aa  125  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  30.69 
 
 		 1075 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3596  phage tape measure protein  35.81 
 
 		 632 aa  119  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0625908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  30.59 
 
 		 1080 aa  110  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  28.05 
 
 		 1080 aa  110  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  28.05 
 
 		 1080 aa  110  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1030  bacteriophage tail tape meausure protein  31.67 
 
 		 1282 aa  109  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.519663 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4099  phage tape measure protein  37.61 
 
 		 1137 aa  105  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2890  phage tape measure protein  37.61 
 
 		 1137 aa  105  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  30.87 
 
 		 921 aa  102  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  29.58 
 
 		 915 aa  97.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  26.96 
 
 		 991 aa  94  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  28.35 
 
 		 668 aa  88.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  30.77 
 
 		 671 aa  85.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  29.96 
 
 		 760 aa  83.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2488  phage tape measure protein  29.81 
 
 		 611 aa  81.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1441  phage tape measure protein  38.6 
 
 		 706 aa  80.5  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  27.87 
 
 		 1104 aa  71.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0788  phage tape measure protein  28.98 
 
 		 866 aa  60.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  32.57 
 
 		 849 aa  50.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  31.21 
 
 		 853 aa  49.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  31.21 
 
 		 853 aa  49.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  32 
 
 		 853 aa  47.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>