71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2104 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  77.52 
 
 		 859 aa  1280    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  97.42 
 
 		 849 aa  1601    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  77.52 
 
 		 859 aa  1280    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  82.19 
 
 		 857 aa  1354    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  98.83 
 
 		 853 aa  1710    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  98.83 
 
 		 853 aa  1710    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 853 aa  1726    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  79.73 
 
 		 881 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  80.27 
 
 		 881 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  79.19 
 
 		 870 aa  540  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  79.46 
 
 		 881 aa  538  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  79.46 
 
 		 881 aa  538  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  29.3 
 
 		 1167 aa  271  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  28.69 
 
 		 914 aa  243  9e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  27.04 
 
 		 908 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  26.93 
 
 		 1122 aa  204  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  25.51 
 
 		 1021 aa  197  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  24.84 
 
 		 1031 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  25.13 
 
 		 1031 aa  147  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  25.29 
 
 		 1028 aa  147  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  25.29 
 
 		 1028 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  25.03 
 
 		 1028 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  32.34 
 
 		 970 aa  135  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  25.92 
 
 		 957 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2235  prophage tail length tape measure  29.02 
 
 		 1113 aa  123  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3255  prophage tail length tape measure  29.33 
 
 		 1555 aa  113  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0755523  decreased coverage  0.000000000000332378 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  34.07 
 
 		 1835 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  32.37 
 
 		 1906 aa  109  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  25.45 
 
 		 1161 aa  107  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  26.19 
 
 		 1080 aa  104  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  26.24 
 
 		 1080 aa  104  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  25.97 
 
 		 1080 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  25.97 
 
 		 1080 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  26.67 
 
 		 1075 aa  100  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  34 
 
 		 669 aa  100  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  25.72 
 
 		 1063 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  44.88 
 
 		 1096 aa  95.1  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  37.58 
 
 		 1160 aa  92  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  37.22 
 
 		 1263 aa  89  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  36.97 
 
 		 1190 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  36.99 
 
 		 1353 aa  84.3  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  57.81 
 
 		 1203 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  57.81 
 
 		 1248 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  23.38 
 
 		 936 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  40.82 
 
 		 1285 aa  71.2  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  50.88 
 
 		 915 aa  70.9  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1180  Prophage tail length tape measure  25.19 
 
 		 1707 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537045  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  25.23 
 
 		 1222 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  33.13 
 
 		 1192 aa  68.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  42.39 
 
 		 139 aa  68.2  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  34 
 
 		 794 aa  66.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  43.82 
 
 		 701 aa  64.7  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7153  prophage tail length tape measure  23.57 
 
 		 913 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  29.88 
 
 		 1115 aa  62  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  33.77 
 
 		 783 aa  60.8  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  35.45 
 
 		 1120 aa  58.5  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2277  putative phage tail protein  42.47 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  47.54 
 
 		 968 aa  57.8  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  41.43 
 
 		 1628 aa  56.2  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1366 aa  55.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1354 aa  55.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  27.08 
 
 		 924 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  23.49 
 
 		 1095 aa  50.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  44.9 
 
 		 1268 aa  50.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  44.62 
 
 		 1164 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1032 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  44.44 
 
 		 1343 aa  48.9  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2489  phage tape measure protein  31.36 
 
 		 1527 aa  47.8  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1231  hypothetical protein  48 
 
 		 647 aa  47.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1032 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3465  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  45.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.144741  normal  0.767514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>