54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3255 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3255  prophage tail length tape measure  100 
 
 		 1555 aa  3088    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0755523  decreased coverage  0.000000000000332378 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  35.53 
 
 		 1835 aa  380  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4676  hypothetical protein  36.53 
 
 		 1609 aa  343  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1331  hypothetical protein  34.18 
 
 		 1655 aa  343  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  33.86 
 
 		 1906 aa  288  8e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  31.24 
 
 		 914 aa  273  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  50.56 
 
 		 1122 aa  267  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2235  prophage tail length tape measure  50.71 
 
 		 1113 aa  236  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  46.49 
 
 		 970 aa  230  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  32.77 
 
 		 957 aa  213  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  40.31 
 
 		 908 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  26.69 
 
 		 1028 aa  152  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  26.49 
 
 		 1028 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  26.83 
 
 		 1028 aa  150  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  30.55 
 
 		 1167 aa  149  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  32.09 
 
 		 1031 aa  149  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  30.83 
 
 		 1031 aa  149  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  30.73 
 
 		 1063 aa  147  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  35.77 
 
 		 859 aa  147  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  35.77 
 
 		 859 aa  147  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  34.67 
 
 		 857 aa  144  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  29.33 
 
 		 849 aa  132  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  29.33 
 
 		 853 aa  132  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  29.53 
 
 		 853 aa  129  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  29.53 
 
 		 853 aa  129  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  34.3 
 
 		 1021 aa  122  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  34.17 
 
 		 1161 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  30.72 
 
 		 881 aa  99  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  30.72 
 
 		 881 aa  99  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  30.72 
 
 		 881 aa  93.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  30.1 
 
 		 870 aa  93.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  30.72 
 
 		 881 aa  93.2  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  26.43 
 
 		 1115 aa  83.2  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1180  Prophage tail length tape measure  35.33 
 
 		 1707 aa  81.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7153  prophage tail length tape measure  24.15 
 
 		 913 aa  66.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1127 aa  65.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  30.67 
 
 		 1190 aa  63.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  37.82 
 
 		 783 aa  60.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1032 aa  59.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1032 aa  58.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1263 aa  56.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2277  putative phage tail protein  57.78 
 
 		 342 aa  56.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1164 aa  55.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1378  hypothetical protein  29.93 
 
 		 311 aa  51.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1311  hypothetical protein  32.46 
 
 		 735 aa  49.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2089  hypothetical protein  32.46 
 
 		 735 aa  49.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  27.76 
 
 		 1160 aa  49.3  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3368  hypothetical protein  31.39 
 
 		 1724 aa  48.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1636  lambda family phage tail tape measure protein  29.23 
 
 		 1668 aa  48.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3328  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1632 aa  48.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.053568 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2059  phage tail tape measure protein  32.77 
 
 		 1673 aa  47.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3250  hypothetical protein  46.81 
 
 		 130 aa  46.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497313  hitchhiker  0.0000000000000595328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1353 aa  46.2  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3791  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1724 aa  45.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>