68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3126 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_10049  tail component  49.67 
 
 		 853 aa  698    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  97.28 
 
 		 881 aa  1504    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  100 
 
 		 881 aa  1762    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  95.07 
 
 		 859 aa  711    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  97.28 
 
 		 881 aa  1504    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  98.75 
 
 		 881 aa  1743    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  48.42 
 
 		 849 aa  654    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  95.07 
 
 		 859 aa  711    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  93.37 
 
 		 870 aa  1426    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  49.4 
 
 		 853 aa  689    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  49.67 
 
 		 853 aa  698    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  83.95 
 
 		 857 aa  616  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  29.7 
 
 		 1167 aa  235  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  26.56 
 
 		 914 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  26.32 
 
 		 1122 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  24.97 
 
 		 1021 aa  141  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  25.19 
 
 		 1031 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  25.06 
 
 		 1031 aa  131  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  24.65 
 
 		 1028 aa  120  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  29.43 
 
 		 1161 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  25 
 
 		 1028 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  24.46 
 
 		 1028 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  27.51 
 
 		 970 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  25.42 
 
 		 1080 aa  95.1  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  45.24 
 
 		 1096 aa  94.7  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  26.13 
 
 		 1080 aa  94.7  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 1160 aa  94.7  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  25.05 
 
 		 1080 aa  94.4  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  26.13 
 
 		 1080 aa  94.4  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  35.23 
 
 		 1190 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1248 aa  91.7  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1203 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1263 aa  87.8  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  39.73 
 
 		 1353 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  27.48 
 
 		 908 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  25.66 
 
 		 1075 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  24.91 
 
 		 957 aa  78.2  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  34.55 
 
 		 1192 aa  72.8  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  35.83 
 
 		 915 aa  72  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  58.93 
 
 		 139 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  26.09 
 
 		 1222 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  36 
 
 		 794 aa  68.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  45.35 
 
 		 1285 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  29.05 
 
 		 1063 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  54.69 
 
 		 701 aa  65.5  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  58 
 
 		 1906 aa  65.1  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3255  prophage tail length tape measure  47.44 
 
 		 1555 aa  63.9  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0755523  decreased coverage  0.000000000000332378 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  25.87 
 
 		 1095 aa  64.3  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  56.25 
 
 		 1835 aa  63.9  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  31.9 
 
 		 921 aa  63.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  33.07 
 
 		 783 aa  57.8  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2277  putative phage tail protein  42.25 
 
 		 342 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1366 aa  57.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  43.48 
 
 		 1628 aa  56.6  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1354 aa  56.2  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  21.37 
 
 		 1032 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1127 aa  55.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  47.46 
 
 		 968 aa  54.3  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  25.36 
 
 		 1115 aa  54.3  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  50 
 
 		 1120 aa  54.3  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  21.57 
 
 		 1032 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  42.35 
 
 		 1343 aa  52.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  26.38 
 
 		 924 aa  51.2  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1180  Prophage tail length tape measure  28.5 
 
 		 1707 aa  50.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  46.81 
 
 		 1268 aa  50.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  23.14 
 
 		 1380 aa  48.1  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1231  hypothetical protein  48 
 
 		 647 aa  47.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1164 aa  45.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>