31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0293 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  48.86 
 
 		 1285 aa  801    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  100 
 
 		 1164 aa  2271    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  36.68 
 
 		 1160 aa  425  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  34.74 
 
 		 1190 aa  387  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  34.42 
 
 		 1192 aa  334  5e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  32.66 
 
 		 1353 aa  333  8e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1203 aa  303  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1248 aa  299  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1263 aa  265  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  32.05 
 
 		 1115 aa  185  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1096 aa  142  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  28.39 
 
 		 1032 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  32.04 
 
 		 1268 aa  108  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  29.29 
 
 		 921 aa  90.9  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1127 aa  90.1  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  43.51 
 
 		 914 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  32.49 
 
 		 968 aa  75.5  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  38.66 
 
 		 915 aa  70.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6515  hypothetical protein  48.65 
 
 		 129 aa  69.7  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  36.81 
 
 		 1122 aa  68.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0288  hypothetical protein  37.31 
 
 		 781 aa  68.2  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  41.27 
 
 		 701 aa  67  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  32.66 
 
 		 669 aa  65.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  28.57 
 
 		 1063 aa  58.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  32.11 
 
 		 1032 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  28.4 
 
 		 1167 aa  53.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  34.45 
 
 		 794 aa  52.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  44.16 
 
 		 139 aa  52  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  42.86 
 
 		 1120 aa  47  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  31.28 
 
 		 908 aa  47  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  35.05 
 
 		 783 aa  46.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>