70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3873 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  58.33 
 
 		 1263 aa  1140    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  100 
 
 		 1190 aa  2333    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  89.27 
 
 		 1192 aa  1805    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  58.81 
 
 		 1353 aa  1147    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  49.69 
 
 		 1203 aa  964    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  50.13 
 
 		 1248 aa  982    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  43.34 
 
 		 1160 aa  664    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  35.3 
 
 		 1164 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  33.86 
 
 		 1285 aa  349  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  34.58 
 
 		 1096 aa  342  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1032 aa  278  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  36.07 
 
 		 1115 aa  218  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  34 
 
 		 1032 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  39.27 
 
 		 1268 aa  143  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5700  hypothetical protein  35.44 
 
 		 457 aa  139  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  35.61 
 
 		 1127 aa  132  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  46.62 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  45.07 
 
 		 237 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  43.05 
 
 		 671 aa  112  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  41.13 
 
 		 915 aa  107  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  41.26 
 
 		 783 aa  102  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  28.95 
 
 		 914 aa  100  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  33.92 
 
 		 921 aa  98.2  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  41.55 
 
 		 871 aa  92.4  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  54.43 
 
 		 139 aa  90.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  33.17 
 
 		 669 aa  90.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  27.62 
 
 		 1122 aa  90.1  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  37.81 
 
 		 701 aa  89.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  29.5 
 
 		 1063 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  33.65 
 
 		 968 aa  80.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  34.19 
 
 		 794 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  33.9 
 
 		 908 aa  78.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  27.12 
 
 		 1167 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  37.16 
 
 		 881 aa  69.3  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  32.18 
 
 		 1364 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  36.61 
 
 		 881 aa  67  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  56.9 
 
 		 1120 aa  66.6  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  28.08 
 
 		 970 aa  66.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  30.66 
 
 		 881 aa  65.9  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  30.66 
 
 		 881 aa  65.9  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  62.22 
 
 		 870 aa  64.3  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  36.97 
 
 		 859 aa  64.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  36.97 
 
 		 859 aa  64.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  29.24 
 
 		 1906 aa  64.3  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  33.33 
 
 		 849 aa  63.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  34.31 
 
 		 857 aa  63.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  36.36 
 
 		 853 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0288  hypothetical protein  34.69 
 
 		 781 aa  63.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  63.79 
 
 		 853 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  63.79 
 
 		 853 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  26.32 
 
 		 1835 aa  61.6  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  27.4 
 
 		 1028 aa  60.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  27.78 
 
 		 1021 aa  60.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  27.13 
 
 		 1031 aa  59.7  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  27.05 
 
 		 1028 aa  59.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  27.24 
 
 		 1031 aa  59.3  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  27.05 
 
 		 1028 aa  59.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  42.25 
 
 		 1628 aa  58.9  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  35.34 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1231  hypothetical protein  50 
 
 		 647 aa  56.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1606  hypothetical protein  31.47 
 
 		 682 aa  54.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3255  prophage tail length tape measure  27.53 
 
 		 1555 aa  53.5  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0755523  decreased coverage  0.000000000000332378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  26.7 
 
 		 1161 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  31.34 
 
 		 1222 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  25.57 
 
 		 957 aa  52  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  45.83 
 
 		 1343 aa  50.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2447  hypothetical protein  35.56 
 
 		 718 aa  48.9  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  29.07 
 
 		 289 aa  48.5  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3346  hypothetical protein  27.85 
 
 		 682 aa  46.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.677729  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  33.33 
 
 		 638 aa  45.8  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>