80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0908 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  59.88 
 
 		 1028 aa  1123    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  63.31 
 
 		 1031 aa  1230    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  59.96 
 
 		 1028 aa  1126    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  63.31 
 
 		 1031 aa  1232    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  59.86 
 
 		 1028 aa  1126    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  100 
 
 		 1021 aa  2051    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  27.3 
 
 		 1063 aa  251  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  29.78 
 
 		 914 aa  243  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  29.78 
 
 		 908 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  30.61 
 
 		 1122 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  27.77 
 
 		 1161 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  36.26 
 
 		 1080 aa  198  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  36.26 
 
 		 1080 aa  198  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  27.34 
 
 		 957 aa  197  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  35.67 
 
 		 1080 aa  194  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  35.67 
 
 		 1080 aa  194  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  25.57 
 
 		 853 aa  182  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  25.57 
 
 		 853 aa  182  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  25.57 
 
 		 853 aa  182  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  25.39 
 
 		 849 aa  177  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  33.51 
 
 		 1075 aa  174  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  26.42 
 
 		 857 aa  170  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  24.14 
 
 		 1167 aa  166  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  24.75 
 
 		 859 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  24.75 
 
 		 859 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  25.65 
 
 		 936 aa  144  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  27.49 
 
 		 970 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  30.3 
 
 		 1906 aa  130  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  29.96 
 
 		 1366 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  29.96 
 
 		 1354 aa  122  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  29.68 
 
 		 1251 aa  119  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  34.87 
 
 		 1835 aa  119  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7153  prophage tail length tape measure  28.62 
 
 		 913 aa  115  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3255  prophage tail length tape measure  35.82 
 
 		 1555 aa  115  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0755523  decreased coverage  0.000000000000332378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  30.57 
 
 		 1104 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  32.08 
 
 		 1222 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  24.27 
 
 		 881 aa  110  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  23.87 
 
 		 881 aa  105  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  23.87 
 
 		 881 aa  105  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  23.87 
 
 		 881 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  24.05 
 
 		 870 aa  101  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  26.14 
 
 		 1380 aa  99.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0780  hypothetical protein  38.27 
 
 		 612 aa  97.8  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08240  hypothetical protein  37.65 
 
 		 611 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139555 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1180  Prophage tail length tape measure  29.56 
 
 		 1707 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  27.44 
 
 		 1095 aa  86.3  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2235  prophage tail length tape measure  35.87 
 
 		 1113 aa  86.3  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1643  phage tape measure protein  29.51 
 
 		 938 aa  79  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4975  gene transfer agent (GTA) orfg11  42.16 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  hitchhiker  0.000111577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0915  phage-related minor tail protein-like protein  40.2 
 
 		 205 aa  67  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2167  hypothetical protein  40.91 
 
 		 222 aa  66.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1068  phage-related minor tail protein-like  32.53 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.136113 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1642  Phage-related minor tail protein-like  52.38 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1418  gene transfer agent (GTA) orfg11  55.93 
 
 		 208 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303639  normal  0.105083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3462  gene transfer agent (GTA) orfg11  39.47 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2891  phage-related minor tail protein-like  49.23 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402699  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1986  gene transfer agent (GTA) orfg11  36 
 
 		 188 aa  60.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.526673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1696  gene transfer agent (GTA) orfg11  65.22 
 
 		 208 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1349  hypothetical protein  61.22 
 
 		 199 aa  61.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000819599  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1422  gene transfer agent (GTA) orfg11  65.22 
 
 		 208 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0992875  normal  0.120159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2112  gene transfer agent (GTA) like protein  51.52 
 
 		 197 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631991  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1577  lambda family phage tail tape measure protein  27.32 
 
 		 813 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.017316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4103  hypothetical protein  27.23 
 
 		 814 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1177  gene transfer agent (GTA) like protein  31.11 
 
 		 194 aa  57.4  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1140  putative phage tail minor protein  48.61 
 
 		 216 aa  57.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1085  hypothetical protein  48.61 
 
 		 217 aa  56.6  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0521861 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  41.18 
 
 		 924 aa  56.2  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1349  lambda family phage tail tape measure protein  27.16 
 
 		 853 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.179371 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2475  putative phage tail minor protein  47.22 
 
 		 206 aa  55.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0334459  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2689  hypothetical protein  34.25 
 
 		 1056 aa  54.7  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1820  gene transfer agent (GTA) like protein  52.08 
 
 		 195 aa  54.3  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_004310  BR0597  hypothetical protein  58.33 
 
 		 181 aa  53.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0597  hypothetical protein  58.33 
 
 		 189 aa  52.8  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1422  gene transfer agent (GTA) like protein  33.57 
 
 		 194 aa  52.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3164  gene transfer agent (GTA) orfg11  49.12 
 
 		 190 aa  51.6  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939369  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  26.73 
 
 		 1190 aa  48.1  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4676  hypothetical protein  53.19 
 
 		 1609 aa  47  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1263 aa  46.2  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1353 aa  45.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0089  putative phage tail tape measure protein  37.29 
 
 		 1521 aa  44.7  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>