26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2277 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2277  putative phage tail protein  100 
 
 		 342 aa  692    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  34.64 
 
 		 1122 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  44.12 
 
 		 914 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  34.07 
 
 		 970 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  36.13 
 
 		 1161 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2235  prophage tail length tape measure  58.82 
 
 		 1113 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  56 
 
 		 1835 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  42.47 
 
 		 853 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  42.47 
 
 		 853 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  42.47 
 
 		 853 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  49.18 
 
 		 1906 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  42.47 
 
 		 849 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  48.33 
 
 		 957 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  42.25 
 
 		 881 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  42.25 
 
 		 881 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  42.25 
 
 		 881 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  42.25 
 
 		 881 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  55.81 
 
 		 870 aa  56.6  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3255  prophage tail length tape measure  57.78 
 
 		 1555 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0755523  decreased coverage  0.000000000000332378 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  40.58 
 
 		 859 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  40.58 
 
 		 859 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  40.58 
 
 		 857 aa  53.9  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57112  predicted protein  32.35 
 
 		 232 aa  50.4  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.532654  normal  0.460781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  58.97 
 
 		 908 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  30.34 
 
 		 1167 aa  47.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  30.69 
 
 		 1115 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>