61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2200 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  100 
 
 		 1167 aa  2355    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  28.52 
 
 		 914 aa  267  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  30.33 
 
 		 859 aa  264  8.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  30.33 
 
 		 859 aa  264  8.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  27.95 
 
 		 908 aa  262  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  27.17 
 
 		 1122 aa  258  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  28.75 
 
 		 853 aa  258  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  28.91 
 
 		 857 aa  254  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  28.61 
 
 		 853 aa  252  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  28.61 
 
 		 853 aa  252  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  28.21 
 
 		 849 aa  246  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  28 
 
 		 957 aa  219  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  29.43 
 
 		 870 aa  186  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  29.07 
 
 		 881 aa  180  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  29.07 
 
 		 881 aa  180  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  29.32 
 
 		 881 aa  179  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  29.68 
 
 		 881 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  24.47 
 
 		 1021 aa  174  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  25.83 
 
 		 1028 aa  171  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  25.9 
 
 		 1028 aa  171  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  25.19 
 
 		 1161 aa  170  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  25.76 
 
 		 1028 aa  167  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  25.54 
 
 		 1031 aa  161  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  25.39 
 
 		 1031 aa  160  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  25.79 
 
 		 1063 aa  154  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  31.6 
 
 		 970 aa  144  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3255  prophage tail length tape measure  29.86 
 
 		 1555 aa  132  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0755523  decreased coverage  0.000000000000332378 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  31.59 
 
 		 1835 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  28.42 
 
 		 1222 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  35.2 
 
 		 1906 aa  107  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2235  prophage tail length tape measure  31.4 
 
 		 1113 aa  102  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1180  Prophage tail length tape measure  29.08 
 
 		 1707 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7153  prophage tail length tape measure  24.74 
 
 		 913 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  37.72 
 
 		 669 aa  85.9  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  41.41 
 
 		 1096 aa  79.7  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  27.08 
 
 		 1160 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  31.58 
 
 		 1190 aa  76.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3101  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  76.3  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00419484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  53.12 
 
 		 1353 aa  73.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  53.45 
 
 		 1248 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1263 aa  70.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  51.79 
 
 		 1203 aa  67  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  46.34 
 
 		 794 aa  65.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  39.36 
 
 		 1285 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  40.37 
 
 		 701 aa  63.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  38.46 
 
 		 139 aa  62.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  25.42 
 
 		 936 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  42.86 
 
 		 921 aa  57.4  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  47.27 
 
 		 1192 aa  57  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  42.25 
 
 		 1120 aa  55.5  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  22.8 
 
 		 1032 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1164 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2277  putative phage tail protein  25.67 
 
 		 342 aa  53.1  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  38.67 
 
 		 1628 aa  52.4  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2082  tail length tape measure protein, internal deletion  32.16 
 
 		 277 aa  52  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000504632  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  41.38 
 
 		 1343 aa  52  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  40.91 
 
 		 968 aa  51.6  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1231  hypothetical protein  44.44 
 
 		 647 aa  49.3  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  46 
 
 		 1268 aa  49.3  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1366 aa  48.5  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1354 aa  48.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>