59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1628 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  100 
 
 		 1906 aa  3771    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  91.08 
 
 		 1835 aa  2985    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3255  prophage tail length tape measure  38.75 
 
 		 1555 aa  288  8e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0755523  decreased coverage  0.000000000000332378 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  35.8 
 
 		 914 aa  278  8e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  38.92 
 
 		 1122 aa  276  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  32.72 
 
 		 957 aa  265  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  43.3 
 
 		 970 aa  244  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  49.04 
 
 		 908 aa  228  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2235  prophage tail length tape measure  52.52 
 
 		 1113 aa  226  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  33.78 
 
 		 1167 aa  184  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  32.17 
 
 		 1028 aa  166  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  32.16 
 
 		 1028 aa  164  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  32.26 
 
 		 1028 aa  164  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  31.96 
 
 		 1031 aa  163  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  31.96 
 
 		 1031 aa  163  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  35.05 
 
 		 1063 aa  159  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3368  hypothetical protein  31.81 
 
 		 1724 aa  159  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3791  hypothetical protein  30.84 
 
 		 1724 aa  153  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1636  lambda family phage tail tape measure protein  31.58 
 
 		 1668 aa  152  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1331  hypothetical protein  29.54 
 
 		 1655 aa  152  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3328  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1632 aa  151  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.053568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  28.55 
 
 		 1161 aa  149  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  30.7 
 
 		 1021 aa  142  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4676  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1609 aa  138  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  32.37 
 
 		 849 aa  132  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  32.37 
 
 		 853 aa  132  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  29.93 
 
 		 859 aa  132  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  29.93 
 
 		 859 aa  132  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  31.67 
 
 		 857 aa  131  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  32.01 
 
 		 853 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  32.01 
 
 		 853 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1657  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1508 aa  95.1  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  27.25 
 
 		 1451 aa  95.1  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1611  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1507 aa  89.7  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  29.41 
 
 		 1115 aa  81.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  30.2 
 
 		 881 aa  80.5  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  30.2 
 
 		 881 aa  80.5  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7153  prophage tail length tape measure  24.65 
 
 		 913 aa  75.9  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  29.93 
 
 		 1190 aa  73.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1263 aa  71.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1032 aa  69.3  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  30 
 
 		 1032 aa  65.9  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  58 
 
 		 881 aa  65.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  58 
 
 		 881 aa  64.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1353 aa  63.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  52.46 
 
 		 870 aa  63.2  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1096 aa  60.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  40.38 
 
 		 783 aa  60.1  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1192 aa  59.7  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2277  putative phage tail protein  49.18 
 
 		 342 aa  58.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1127 aa  55.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  27.54 
 
 		 1285 aa  54.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  27.76 
 
 		 1160 aa  54.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1311  hypothetical protein  39.08 
 
 		 735 aa  51.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1164 aa  51.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2089  hypothetical protein  39.08 
 
 		 735 aa  51.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  24.23 
 
 		 936 aa  48.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1378  hypothetical protein  32.93 
 
 		 311 aa  47.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1203 aa  48.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>