24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4676 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4676  hypothetical protein  100 
 
 		 1609 aa  3207    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3255  prophage tail length tape measure  42.15 
 
 		 1555 aa  320  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0755523  decreased coverage  0.000000000000332378 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  30.7 
 
 		 1906 aa  134  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  29.91 
 
 		 1835 aa  129  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2826  hypothetical protein  29.96 
 
 		 893 aa  91.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1388  hypothetical protein  28.36 
 
 		 346 aa  70.5  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3355  putative tape measure protein  28.99 
 
 		 775 aa  63.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2697  hypothetical protein  25.23 
 
 		 553 aa  61.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2103  phage tape measure protein  24.67 
 
 		 1307 aa  57.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.56214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  45.71 
 
 		 1161 aa  57  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  50 
 
 		 1063 aa  56.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2149  phage tape measure protein  28.85 
 
 		 1308 aa  53.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.843593  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0680  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1308 aa  52.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0537  hypothetical protein  39.29 
 
 		 792 aa  48.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.216857 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0089  putative phage tail tape measure protein  24.37 
 
 		 1521 aa  48.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2167  hypothetical protein  40.43 
 
 		 222 aa  47.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  51.02 
 
 		 1031 aa  47  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  51.02 
 
 		 1031 aa  47  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1068  phage-related minor tail protein-like  57.89 
 
 		 219 aa  46.6  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.136113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  53.19 
 
 		 1021 aa  46.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  46.43 
 
 		 1075 aa  45.8  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1889  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1006 aa  45.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.405118  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4975  gene transfer agent (GTA) orfg11  39.13 
 
 		 192 aa  45.1  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  hitchhiker  0.000111577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  46.43 
 
 		 1080 aa  45.1  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>