20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1889 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1889  hypothetical protein  100 
 
 		 1006 aa  2021    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.405118  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1076  tail tape meausure protein, putative  34.06 
 
 		 974 aa  144  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0274  hypothetical protein  35.84 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  33.14 
 
 		 820 aa  77.8  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  34.88 
 
 		 1115 aa  74.3  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2689  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1056 aa  62.8  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  36.96 
 
 		 1644 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  24.74 
 
 		 1028 aa  48.9  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  24.74 
 
 		 1028 aa  48.9  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  25.29 
 
 		 936 aa  48.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  41.82 
 
 		 1104 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  24.74 
 
 		 1028 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08240  hypothetical protein  27.54 
 
 		 611 aa  45.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0780  hypothetical protein  31.71 
 
 		 612 aa  45.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0855  hypothetical protein  20.83 
 
 		 1829 aa  45.1  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.890164  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  33.06 
 
 		 1366 aa  45.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  37.5 
 
 		 914 aa  45.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2489  phage tape measure protein  34.65 
 
 		 1527 aa  45.1  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  33.06 
 
 		 1354 aa  44.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  47.37 
 
 		 783 aa  44.3  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>