56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_08240 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0780  hypothetical protein  94.77 
 
 		 612 aa  1151    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08240  hypothetical protein  100 
 
 		 611 aa  1211    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139555 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  37.55 
 
 		 1161 aa  160  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  38.59 
 
 		 1063 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  39.89 
 
 		 1104 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  28.85 
 
 		 1028 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  28.85 
 
 		 1028 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  28.85 
 
 		 1028 aa  97.8  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  37.2 
 
 		 1021 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  37.66 
 
 		 1031 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  37.66 
 
 		 1031 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  30.4 
 
 		 1080 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  30.4 
 
 		 1080 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  30.4 
 
 		 1080 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  30.4 
 
 		 1080 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  48.81 
 
 		 908 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  41.11 
 
 		 1222 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  35.03 
 
 		 1251 aa  70.9  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  34.64 
 
 		 957 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1349  hypothetical protein  47.37 
 
 		 199 aa  62.4  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000819599  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2167  hypothetical protein  41.9 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3462  gene transfer agent (GTA) orfg11  32.68 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  38.82 
 
 		 1366 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1986  gene transfer agent (GTA) orfg11  34.87 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.526673 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  42.11 
 
 		 1354 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1068  phage-related minor tail protein-like  37.86 
 
 		 219 aa  60.1  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.136113 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  29.03 
 
 		 1075 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  26.56 
 
 		 914 aa  59.3  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  40.91 
 
 		 936 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  35.09 
 
 		 1095 aa  56.2  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2891  phage-related minor tail protein-like  56.52 
 
 		 223 aa  55.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402699  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1820  gene transfer agent (GTA) like protein  34.46 
 
 		 195 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4975  gene transfer agent (GTA) orfg11  53.97 
 
 		 192 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  hitchhiker  0.000111577 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1140  putative phage tail minor protein  31.47 
 
 		 216 aa  55.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3164  gene transfer agent (GTA) orfg11  49.28 
 
 		 190 aa  55.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939369  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1177  gene transfer agent (GTA) like protein  35.07 
 
 		 194 aa  55.1  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2689  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1056 aa  53.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1642  Phage-related minor tail protein-like  40.7 
 
 		 222 aa  53.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2112  gene transfer agent (GTA) like protein  32.67 
 
 		 197 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0915  phage-related minor tail protein-like protein  47.78 
 
 		 205 aa  51.2  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  36.26 
 
 		 1122 aa  51.6  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0597  hypothetical protein  48.68 
 
 		 189 aa  51.2  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1085  hypothetical protein  38.14 
 
 		 217 aa  51.6  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0521861 
 
 
-
 
NC_004310  BR0597  hypothetical protein  49.33 
 
 		 181 aa  51.2  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2475  putative phage tail minor protein  39.18 
 
 		 206 aa  51.2  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0334459  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1696  gene transfer agent (GTA) orfg11  59.18 
 
 		 208 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1418  gene transfer agent (GTA) orfg11  59.18 
 
 		 208 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303639  normal  0.105083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1422  gene transfer agent (GTA) orfg11  59.18 
 
 		 208 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0992875  normal  0.120159 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1643  phage tape measure protein  42.67 
 
 		 938 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2235  prophage tail length tape measure  36.54 
 
 		 1113 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  40.74 
 
 		 820 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  34.04 
 
 		 924 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1889  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1006 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.405118  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4676  hypothetical protein  46.43 
 
 		 1609 aa  43.9  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  38 
 
 		 1380 aa  43.9  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  39.62 
 
 		 911 aa  43.5  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>