57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0780 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0780  hypothetical protein  100 
 
 
612 aa  1217    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08240  hypothetical protein  94.77 
 
 
611 aa  1083    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000139555 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  37.16 
 
 
1161 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  38.59 
 
 
1063 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  39.89 
 
 
1104 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  29.33 
 
 
1028 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  29.33 
 
 
1028 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  29 
 
 
1028 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  38.27 
 
 
1021 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  37.01 
 
 
1031 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  37.01 
 
 
1031 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  51.19 
 
 
908 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  29.96 
 
 
1080 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  29.96 
 
 
1080 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  29.96 
 
 
1080 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  29.96 
 
 
1080 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  42.22 
 
 
1222 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  32.59 
 
 
1251 aa  71.2  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  34.64 
 
 
957 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  30.11 
 
 
1075 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1349  hypothetical protein  47.37 
 
 
199 aa  62.4  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000819599  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  38.82 
 
 
1366 aa  62  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  38.82 
 
 
1354 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1986  gene transfer agent (GTA) orfg11  34.87 
 
 
188 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.526673 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  26.56 
 
 
914 aa  60.5  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1068  phage-related minor tail protein-like  37.86 
 
 
219 aa  60.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.136113 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2167  hypothetical protein  41.9 
 
 
222 aa  60.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3462  gene transfer agent (GTA) orfg11  33.97 
 
 
196 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251991  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  39.77 
 
 
936 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1140  putative phage tail minor protein  31.47 
 
 
216 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1820  gene transfer agent (GTA) like protein  33.78 
 
 
195 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4975  gene transfer agent (GTA) orfg11  53.97 
 
 
192 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  hitchhiker  0.000111577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3164  gene transfer agent (GTA) orfg11  45.98 
 
 
190 aa  55.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939369  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2891  phage-related minor tail protein-like  56.52 
 
 
223 aa  55.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402699  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1177  gene transfer agent (GTA) like protein  50.75 
 
 
194 aa  55.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  37.36 
 
 
1122 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2112  gene transfer agent (GTA) like protein  32.67 
 
 
197 aa  54.3  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631991  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1642  Phage-related minor tail protein-like  40.7 
 
 
222 aa  53.5  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  34.21 
 
 
1095 aa  52  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1085  hypothetical protein  38.14 
 
 
217 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0521861 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2475  putative phage tail minor protein  39.18 
 
 
206 aa  51.2  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0334459  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0915  phage-related minor tail protein-like protein  50.79 
 
 
205 aa  50.4  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2689  hypothetical protein  33.33 
 
 
1056 aa  50.4  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0597  hypothetical protein  47.37 
 
 
189 aa  50.4  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0597  hypothetical protein  48 
 
 
181 aa  50.4  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1696  gene transfer agent (GTA) orfg11  59.18 
 
 
208 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1422  gene transfer agent (GTA) orfg11  59.18 
 
 
208 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0992875  normal  0.120159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1418  gene transfer agent (GTA) orfg11  59.18 
 
 
208 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303639  normal  0.105083 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  35.48 
 
 
924 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1643  phage tape measure protein  43.48 
 
 
938 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  40.74 
 
 
820 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1889  hypothetical protein  31.71 
 
 
1006 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.405118  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1422  gene transfer agent (GTA) like protein  30.43 
 
 
194 aa  44.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2235  prophage tail length tape measure  35.92 
 
 
1113 aa  44.3  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  38 
 
 
1380 aa  44.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4676  hypothetical protein  46.43 
 
 
1609 aa  44.3  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  39.62 
 
 
911 aa  43.9  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>