87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2237 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  76.92 
 
 		 1075 aa  1581    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  98.43 
 
 		 1080 aa  2136    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  98.33 
 
 		 1080 aa  2133    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  100 
 
 		 1080 aa  2168    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  99.26 
 
 		 1080 aa  2152    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  39.28 
 
 		 1095 aa  577  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  35.67 
 
 		 1021 aa  195  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  36.69 
 
 		 1343 aa  187  7e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  36.04 
 
 		 1318 aa  182  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  35.1 
 
 		 1366 aa  170  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  33.77 
 
 		 1031 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  33.77 
 
 		 1031 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4710  phage tape measure protein  41.33 
 
 		 513 aa  168  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  33.07 
 
 		 1028 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  33.07 
 
 		 1028 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  33.16 
 
 		 1028 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0657  gp21  29.68 
 
 		 1056 aa  145  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011896 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0280  phage tape measure protein  29.85 
 
 		 530 aa  139  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  31.73 
 
 		 1380 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1354 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  30.99 
 
 		 1366 aa  128  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  34.43 
 
 		 1251 aa  126  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  30.51 
 
 		 1644 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1030  bacteriophage tail tape meausure protein  29.29 
 
 		 1282 aa  117  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.519663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  29.97 
 
 		 915 aa  117  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  26.85 
 
 		 668 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  27.97 
 
 		 671 aa  115  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2489  phage tape measure protein  32.5 
 
 		 1527 aa  110  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  28.75 
 
 		 1063 aa  105  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  25.97 
 
 		 991 aa  103  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2890  phage tape measure protein  30.54 
 
 		 1137 aa  102  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4099  phage tape measure protein  30.54 
 
 		 1137 aa  102  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245804 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  27.07 
 
 		 921 aa  100  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  30.85 
 
 		 1161 aa  99.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  34.72 
 
 		 1222 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1643  phage tape measure protein  27.85 
 
 		 938 aa  93.6  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08240  hypothetical protein  30.4 
 
 		 611 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  26.92 
 
 		 1104 aa  86.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0780  hypothetical protein  29.96 
 
 		 612 aa  85.5  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  26.78 
 
 		 914 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  28.19 
 
 		 849 aa  81.6  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  26.36 
 
 		 853 aa  81.3  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  26.36 
 
 		 853 aa  81.3  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  25.74 
 
 		 853 aa  80.5  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3596  phage tape measure protein  27.14 
 
 		 632 aa  80.1  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0625908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  28.04 
 
 		 1122 aa  79.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  29.96 
 
 		 881 aa  79  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1349  lambda family phage tail tape measure protein  28.74 
 
 		 853 aa  78.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.179371 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2488  phage tape measure protein  25.97 
 
 		 611 aa  77.8  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1441  phage tape measure protein  25.14 
 
 		 706 aa  77.4  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  28.57 
 
 		 859 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  28.57 
 
 		 881 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  28.57 
 
 		 859 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  28.57 
 
 		 881 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  28.63 
 
 		 870 aa  76.3  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  24.85 
 
 		 908 aa  75.1  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  27.76 
 
 		 881 aa  74.7  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  28.16 
 
 		 857 aa  73.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  29.95 
 
 		 1451 aa  73.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4975  gene transfer agent (GTA) orfg11  50.63 
 
 		 192 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  hitchhiker  0.000111577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1642  Phage-related minor tail protein-like  37.86 
 
 		 222 aa  69.3  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  24.16 
 
 		 760 aa  68.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1068  phage-related minor tail protein-like  31.25 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.136113 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2167  hypothetical protein  42.67 
 
 		 222 aa  63.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1177  gene transfer agent (GTA) like protein  40.4 
 
 		 194 aa  63.5  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1140  putative phage tail minor protein  46.75 
 
 		 216 aa  62.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3462  gene transfer agent (GTA) orfg11  34.65 
 
 		 196 aa  62  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2475  putative phage tail minor protein  45.45 
 
 		 206 aa  60.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0334459  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1085  hypothetical protein  47.76 
 
 		 217 aa  60.1  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0521861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1577  lambda family phage tail tape measure protein  23.58 
 
 		 813 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.017316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0915  phage-related minor tail protein-like protein  42.68 
 
 		 205 aa  59.7  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1418  gene transfer agent (GTA) orfg11  41.67 
 
 		 208 aa  59.3  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303639  normal  0.105083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2235  prophage tail length tape measure  41.41 
 
 		 1113 aa  59.3  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1986  gene transfer agent (GTA) orfg11  40 
 
 		 188 aa  58.9  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.526673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1422  gene transfer agent (GTA) orfg11  34.96 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0992875  normal  0.120159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2112  gene transfer agent (GTA) like protein  34.65 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631991  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1696  gene transfer agent (GTA) orfg11  34.96 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1422  gene transfer agent (GTA) like protein  40 
 
 		 194 aa  57.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1349  hypothetical protein  54.55 
 
 		 199 aa  57.4  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000819599  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4103  hypothetical protein  22.54 
 
 		 814 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2891  phage-related minor tail protein-like  61.36 
 
 		 223 aa  55.5  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402699  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1820  gene transfer agent (GTA) like protein  38.38 
 
 		 195 aa  55.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  25.9 
 
 		 957 aa  55.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3164  gene transfer agent (GTA) orfg11  48.28 
 
 		 190 aa  53.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939369  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_004310  BR0597  hypothetical protein  56.41 
 
 		 181 aa  49.7  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0597  hypothetical protein  56.41 
 
 		 189 aa  49.3  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4676  hypothetical protein  46.43 
 
 		 1609 aa  45.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>