36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1517 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  100 
 
 		 924 aa  1876    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1716  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  91.46 
 
 		 924 aa  1566    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.309525  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  43.14 
 
 		 936 aa  582  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  23.95 
 
 		 1031 aa  107  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  23.52 
 
 		 1031 aa  104  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  25.43 
 
 		 1021 aa  102  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1366 aa  97.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  32.37 
 
 		 1354 aa  95.9  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2477  hypothetical protein  35.29 
 
 		 732 aa  85.9  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  24.19 
 
 		 1063 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3992  hypothetical protein  30.07 
 
 		 738 aa  85.1  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  50.57 
 
 		 970 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  44.64 
 
 		 811 aa  80.1  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  25.9 
 
 		 957 aa  77.8  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1180  Prophage tail length tape measure  44.33 
 
 		 1707 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  35.51 
 
 		 1380 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  67.39 
 
 		 1127 aa  73.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2177  hypothetical protein  58.18 
 
 		 620 aa  64.3  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  25 
 
 		 908 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  54 
 
 		 1173 aa  58.5  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  22.51 
 
 		 1167 aa  57.4  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  26.13 
 
 		 1122 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  22.67 
 
 		 1075 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  25.86 
 
 		 1028 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  25.86 
 
 		 1028 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  25.86 
 
 		 1028 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2089  hypothetical protein  56.86 
 
 		 735 aa  54.7  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1311  hypothetical protein  56.86 
 
 		 735 aa  54.7  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  32.43 
 
 		 1318 aa  54.3  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  27.12 
 
 		 1161 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  39.19 
 
 		 1343 aa  49.7  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  25.76 
 
 		 914 aa  48.9  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0780  hypothetical protein  35.48 
 
 		 612 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  39.13 
 
 		 1366 aa  48.5  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  23.45 
 
 		 1222 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08240  hypothetical protein  34.41 
 
 		 611 aa  45.8  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>