86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2583 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  79.84 
 
 		 914 aa  1387    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  100 
 
 		 1122 aa  2251    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  37.81 
 
 		 908 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  36.68 
 
 		 957 aa  364  6e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  30.75 
 
 		 1063 aa  330  9e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  32.45 
 
 		 970 aa  304  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  31.41 
 
 		 1031 aa  293  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  30.74 
 
 		 1028 aa  292  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  30.74 
 
 		 1028 aa  292  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  31.97 
 
 		 1031 aa  291  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  30.1 
 
 		 1028 aa  290  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  31.04 
 
 		 1161 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  27.18 
 
 		 1167 aa  270  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2235  prophage tail length tape measure  33.66 
 
 		 1113 aa  257  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3255  prophage tail length tape measure  50.56 
 
 		 1555 aa  244  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0755523  decreased coverage  0.000000000000332378 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  48.28 
 
 		 1835 aa  242  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  38.54 
 
 		 1906 aa  232  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  29.27 
 
 		 1021 aa  231  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  27.96 
 
 		 859 aa  204  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  27.96 
 
 		 859 aa  204  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  26.87 
 
 		 853 aa  203  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  26.74 
 
 		 853 aa  203  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  26.74 
 
 		 853 aa  203  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  27.27 
 
 		 849 aa  197  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  27.59 
 
 		 857 aa  192  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  36.54 
 
 		 1222 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  27.15 
 
 		 870 aa  174  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  26.86 
 
 		 881 aa  165  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  26.86 
 
 		 881 aa  165  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2277  putative phage tail protein  40.23 
 
 		 342 aa  129  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  25.74 
 
 		 881 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  42.29 
 
 		 921 aa  122  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  25.27 
 
 		 881 aa  121  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1180  Prophage tail length tape measure  31.86 
 
 		 1707 aa  110  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  57.29 
 
 		 1285 aa  105  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1366 aa  103  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1354 aa  103  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  22.49 
 
 		 936 aa  90.9  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  48.51 
 
 		 1268 aa  91.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  32.89 
 
 		 968 aa  89.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1263 aa  87.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7153  prophage tail length tape measure  27.36 
 
 		 913 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  30.82 
 
 		 1190 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  28.21 
 
 		 1080 aa  85.1  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  28.21 
 
 		 1080 aa  85.1  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  54.88 
 
 		 701 aa  84.7  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1349  lambda family phage tail tape measure protein  31.38 
 
 		 853 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.179371 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  26.98 
 
 		 1075 aa  82.4  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  27.51 
 
 		 1080 aa  82.4  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  27.51 
 
 		 1080 aa  82.4  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  36.62 
 
 		 1192 aa  82  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  41.88 
 
 		 915 aa  81.6  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0288  hypothetical protein  47.33 
 
 		 781 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  30.28 
 
 		 1380 aa  79  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  48.39 
 
 		 1164 aa  76.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  38.76 
 
 		 1096 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  31.12 
 
 		 1248 aa  73.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  30.57 
 
 		 794 aa  71.6  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  27.65 
 
 		 1115 aa  71.6  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  35.03 
 
 		 1160 aa  71.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1032 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  41.38 
 
 		 139 aa  70.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  28.49 
 
 		 1104 aa  68.6  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  39.78 
 
 		 669 aa  67.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  53.33 
 
 		 1203 aa  65.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0274  hypothetical protein  35.77 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  31.72 
 
 		 1353 aa  63.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  27.95 
 
 		 924 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  25.08 
 
 		 1251 aa  62.8  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  29.46 
 
 		 1032 aa  62.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2082  tail length tape measure protein, internal deletion  35.37 
 
 		 277 aa  62  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000504632  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1577  lambda family phage tail tape measure protein  30.23 
 
 		 813 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.017316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0780  hypothetical protein  27.09 
 
 		 612 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  41.11 
 
 		 783 aa  59.3  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08240  hypothetical protein  27.49 
 
 		 611 aa  58.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1127 aa  58.5  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  26.58 
 
 		 1120 aa  57.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  37.12 
 
 		 1628 aa  56.2  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4103  hypothetical protein  29.37 
 
 		 814 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  43.86 
 
 		 1095 aa  55.5  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2689  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1056 aa  53.5  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2089  hypothetical protein  29.29 
 
 		 735 aa  52  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1311  hypothetical protein  29.29 
 
 		 735 aa  52  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0089  putative phage tail tape measure protein  42.62 
 
 		 1521 aa  50.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  41.38 
 
 		 820 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1880  hypothetical protein  36.36 
 
 		 698 aa  45.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.384763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>