68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1688 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  69.73 
 
 		 1380 aa  1665    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  97 
 
 		 1366 aa  2317    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  100 
 
 		 1354 aa  2661    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2489  phage tape measure protein  50.47 
 
 		 1527 aa  171  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  41.48 
 
 		 1222 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0280  phage tape measure protein  40.38 
 
 		 530 aa  156  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  34.87 
 
 		 1366 aa  149  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  30.79 
 
 		 908 aa  144  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  35.34 
 
 		 1318 aa  142  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  30.34 
 
 		 1095 aa  139  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  33.33 
 
 		 1343 aa  139  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  31.63 
 
 		 1080 aa  132  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4710  phage tape measure protein  30.77 
 
 		 513 aa  132  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  31.12 
 
 		 1075 aa  130  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  28.86 
 
 		 1031 aa  130  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  28.86 
 
 		 1031 aa  129  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  28.88 
 
 		 1021 aa  129  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  27.27 
 
 		 1028 aa  128  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  27.27 
 
 		 1028 aa  128  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  31.84 
 
 		 1251 aa  124  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  27.63 
 
 		 1028 aa  124  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  33.57 
 
 		 1644 aa  118  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  31.63 
 
 		 1080 aa  116  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  31.63 
 
 		 1080 aa  116  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  31.63 
 
 		 1080 aa  116  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  29.97 
 
 		 957 aa  116  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  28.27 
 
 		 1122 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  28.09 
 
 		 914 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  29.7 
 
 		 991 aa  111  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0657  gp21  30.9 
 
 		 1056 aa  109  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011896 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  33.91 
 
 		 924 aa  109  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1030  bacteriophage tail tape meausure protein  27.02 
 
 		 1282 aa  109  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.519663 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3596  phage tape measure protein  32.54 
 
 		 632 aa  106  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0625908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  32.23 
 
 		 1451 aa  104  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2890  phage tape measure protein  35.26 
 
 		 1137 aa  102  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4099  phage tape measure protein  35.26 
 
 		 1137 aa  102  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245804 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  26.88 
 
 		 915 aa  101  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  28.43 
 
 		 921 aa  100  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  28.02 
 
 		 1063 aa  85.5  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  35.22 
 
 		 936 aa  82.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1716  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  32.17 
 
 		 924 aa  77  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.309525  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  24.79 
 
 		 1104 aa  75.5  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  26.24 
 
 		 1161 aa  74.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  29.19 
 
 		 760 aa  73.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2477  hypothetical protein  36.71 
 
 		 732 aa  74.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0780  hypothetical protein  30.52 
 
 		 612 aa  70.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  25.33 
 
 		 671 aa  70.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2488  phage tape measure protein  27.13 
 
 		 611 aa  70.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  24.57 
 
 		 668 aa  68.6  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  40.48 
 
 		 811 aa  67.8  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1441  phage tape measure protein  28.12 
 
 		 706 aa  67  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08240  hypothetical protein  30.49 
 
 		 611 aa  67  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139555 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2177  hypothetical protein  41.26 
 
 		 620 aa  67  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3992  hypothetical protein  31.44 
 
 		 738 aa  65.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  43.75 
 
 		 1173 aa  64.3  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2689  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1056 aa  60.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1889  hypothetical protein  33.11 
 
 		 1006 aa  54.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.405118  normal  0.121372 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  25.3 
 
 		 853 aa  52.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  25.3 
 
 		 853 aa  52.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  35.51 
 
 		 1127 aa  51.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  27.1 
 
 		 1167 aa  51.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  47.3 
 
 		 970 aa  49.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3444  phage tape measure protein  30.91 
 
 		 904 aa  49.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  25.06 
 
 		 853 aa  48.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  53.66 
 
 		 820 aa  48.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1107  phage tape measure protein  23.76 
 
 		 1276 aa  47.8  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0274  hypothetical protein  31.15 
 
 		 419 aa  46.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  23.58 
 
 		 857 aa  46.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>