19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0274 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0274  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  831    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  50 
 
 		 820 aa  156  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1889  hypothetical protein  35.84 
 
 		 1006 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.405118  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  37.39 
 
 		 1122 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  44.68 
 
 		 1115 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2689  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1056 aa  61.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  28.02 
 
 		 914 aa  56.6  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  27.61 
 
 		 1104 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0660  hypothetical protein  28.06 
 
 		 990 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0929  hypothetical protein  37.63 
 
 		 174 aa  51.6  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.333514 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  33.33 
 
 		 668 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  32.35 
 
 		 671 aa  49.7  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  28.15 
 
 		 936 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1354 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1366 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  25.53 
 
 		 1644 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  25.33 
 
 		 1063 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  48.21 
 
 		 783 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1646  hypothetical protein  33.04 
 
 		 623 aa  43.9  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327516  normal  0.459319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>