46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0797 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  100 
 
 		 1115 aa  2160    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  33.09 
 
 		 1268 aa  193  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  35.18 
 
 		 1190 aa  184  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  32.82 
 
 		 1164 aa  181  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  33.72 
 
 		 1263 aa  172  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1032 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  33.18 
 
 		 1096 aa  162  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1032 aa  160  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  31.32 
 
 		 1127 aa  157  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  33.93 
 
 		 1192 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  33.59 
 
 		 1160 aa  145  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1203 aa  145  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  29.22 
 
 		 1285 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1248 aa  108  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3708  hypothetical protein  43.24 
 
 		 820 aa  103  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  32.98 
 
 		 1644 aa  79.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  32.84 
 
 		 859 aa  77.8  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  32.84 
 
 		 859 aa  77.8  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  28.23 
 
 		 1122 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1889  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1006 aa  76.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.405118  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  32.84 
 
 		 857 aa  76.3  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  31.93 
 
 		 1835 aa  72.8  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3255  prophage tail length tape measure  27.82 
 
 		 1555 aa  72  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0755523  decreased coverage  0.000000000000332378 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  27.5 
 
 		 914 aa  71.6  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  29.41 
 
 		 1906 aa  70.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0274  hypothetical protein  30.29 
 
 		 419 aa  70.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  24.63 
 
 		 970 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  31.33 
 
 		 853 aa  68.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  31.33 
 
 		 853 aa  68.9  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  31.33 
 
 		 853 aa  68.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  31.33 
 
 		 849 aa  68.6  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  25.75 
 
 		 957 aa  62.4  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  34.62 
 
 		 783 aa  60.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  28.12 
 
 		 1161 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  25.37 
 
 		 1021 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2235  prophage tail length tape measure  27.3 
 
 		 1113 aa  50.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  25.97 
 
 		 908 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7316  hypothetical protein  25.77 
 
 		 674 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198357  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0386  hypothetical protein  24.47 
 
 		 496 aa  48.9  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.306898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  35.35 
 
 		 881 aa  48.5  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  35.35 
 
 		 881 aa  48.5  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  35.35 
 
 		 881 aa  48.5  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  35.35 
 
 		 881 aa  48.5  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2277  putative phage tail protein  30.69 
 
 		 342 aa  47  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  23.18 
 
 		 1167 aa  45.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  25.94 
 
 		 1063 aa  45.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>