40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3717 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  100 
 
 		 1127 aa  2232    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  30.11 
 
 		 1353 aa  188  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1268 aa  180  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  32.35 
 
 		 1115 aa  163  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1263 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  31.98 
 
 		 1032 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1032 aa  131  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  35.61 
 
 		 1190 aa  126  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1248 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 		 1160 aa  112  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1192 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  31.92 
 
 		 1096 aa  102  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3992  hypothetical protein  33.79 
 
 		 738 aa  99  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1203 aa  98.2  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1164 aa  97.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  58.97 
 
 		 924 aa  97.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2477  hypothetical protein  33.02 
 
 		 732 aa  86.7  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  29.12 
 
 		 1285 aa  86.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  29.59 
 
 		 811 aa  74.7  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  33.64 
 
 		 936 aa  72  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  25.42 
 
 		 914 aa  65.5  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  25 
 
 		 1063 aa  64.7  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7153  prophage tail length tape measure  28.17 
 
 		 913 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553544 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  45.98 
 
 		 1354 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  45.98 
 
 		 1366 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  55.36 
 
 		 1380 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  56.36 
 
 		 970 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2414  hypothetical protein  32.82 
 
 		 957 aa  57.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2177  hypothetical protein  42.71 
 
 		 620 aa  58.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  43.75 
 
 		 783 aa  57.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1606  hypothetical protein  35.16 
 
 		 682 aa  57.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  63.16 
 
 		 1173 aa  55.8  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2089  hypothetical protein  44.23 
 
 		 735 aa  53.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1311  hypothetical protein  44.23 
 
 		 735 aa  53.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  23.2 
 
 		 1122 aa  53.5  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3255  prophage tail length tape measure  23.81 
 
 		 1555 aa  50.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0755523  decreased coverage  0.000000000000332378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  26 
 
 		 908 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3791  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1724 aa  48.5  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3346  hypothetical protein  30.57 
 
 		 682 aa  48.9  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.677729  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3368  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1724 aa  47.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>