48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1471 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  100 
 
 		 668 aa  1330    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  94.61 
 
 		 671 aa  1234    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  44.63 
 
 		 921 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3596  phage tape measure protein  47.49 
 
 		 632 aa  223  8e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0625908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  43.04 
 
 		 760 aa  204  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  41.69 
 
 		 915 aa  200  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  41.53 
 
 		 1451 aa  152  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  34.65 
 
 		 1318 aa  113  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  32.68 
 
 		 1343 aa  111  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4710  phage tape measure protein  33.17 
 
 		 513 aa  110  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  26.97 
 
 		 1080 aa  110  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  31.4 
 
 		 1366 aa  108  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  27.51 
 
 		 1075 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  28.24 
 
 		 1644 aa  105  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  27.15 
 
 		 1080 aa  104  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  27.15 
 
 		 1080 aa  104  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  29.25 
 
 		 1080 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  27.48 
 
 		 1095 aa  102  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  43.48 
 
 		 794 aa  99.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0288  hypothetical protein  42.03 
 
 		 781 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  34.1 
 
 		 1251 aa  86.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0280  phage tape measure protein  25.32 
 
 		 530 aa  83.6  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  33.18 
 
 		 1222 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  29.11 
 
 		 1380 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2489  phage tape measure protein  28.35 
 
 		 1527 aa  79  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0657  gp21  28.87 
 
 		 1056 aa  77.8  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011896 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1030  bacteriophage tail tape meausure protein  26.98 
 
 		 1282 aa  72  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.519663 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  40.29 
 
 		 701 aa  72.4  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0634  hypothetical protein  53.85 
 
 		 691 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.486011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1354 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1366 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2414  hypothetical protein  50.7 
 
 		 957 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4099  phage tape measure protein  24.27 
 
 		 1137 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2890  phage tape measure protein  24.27 
 
 		 1137 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1441  phage tape measure protein  24.81 
 
 		 706 aa  58.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2488  phage tape measure protein  31.62 
 
 		 611 aa  57.4  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  22.8 
 
 		 991 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2994  hypothetical protein  32.37 
 
 		 717 aa  53.9  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2485  hypothetical protein  27.33 
 
 		 851 aa  53.5  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.652813  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0274  hypothetical protein  29.44 
 
 		 419 aa  53.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3962  hypothetical protein  37.62 
 
 		 671 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.443491 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1880  hypothetical protein  59.46 
 
 		 698 aa  50.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.384763 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  53.49 
 
 		 957 aa  48.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0929  hypothetical protein  37.21 
 
 		 174 aa  47.8  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.333514 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3161  hypothetical protein  26.11 
 
 		 828 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  32.53 
 
 		 1122 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2477  hypothetical protein  23.47 
 
 		 732 aa  44.3  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3387  hypothetical protein  34.09 
 
 		 715 aa  43.9  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000202252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>