35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1030 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1030  bacteriophage tail tape meausure protein  100 
 
 		 1282 aa  2561    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.519663 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2890  phage tape measure protein  49.53 
 
 		 1137 aa  185  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4099  phage tape measure protein  49.53 
 
 		 1137 aa  185  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245804 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0280  phage tape measure protein  36.96 
 
 		 530 aa  167  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  35.02 
 
 		 1343 aa  166  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  39.35 
 
 		 1366 aa  163  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  38.08 
 
 		 1318 aa  162  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4710  phage tape measure protein  37.96 
 
 		 513 aa  153  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  34.36 
 
 		 1095 aa  152  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0657  gp21  35.41 
 
 		 1056 aa  142  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011896 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  29.97 
 
 		 1080 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  33.19 
 
 		 1380 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  30.64 
 
 		 1080 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  30.64 
 
 		 1080 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  30.64 
 
 		 1080 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  30.15 
 
 		 1075 aa  120  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  30.41 
 
 		 1366 aa  118  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  33.84 
 
 		 1251 aa  117  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1354 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  29.75 
 
 		 1644 aa  107  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2489  phage tape measure protein  31.67 
 
 		 1527 aa  105  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  32.11 
 
 		 1222 aa  104  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3596  phage tape measure protein  28.84 
 
 		 632 aa  97.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0625908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1441  phage tape measure protein  28.03 
 
 		 706 aa  90.5  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  25.52 
 
 		 915 aa  89  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  24.84 
 
 		 1451 aa  83.2  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  26.26 
 
 		 671 aa  83.2  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  25.9 
 
 		 668 aa  79.7  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  24.8 
 
 		 991 aa  78.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2488  phage tape measure protein  29.91 
 
 		 611 aa  77  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  26.78 
 
 		 760 aa  76.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  24.91 
 
 		 921 aa  76.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0788  phage tape measure protein  20 
 
 		 866 aa  50.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3894  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1925 aa  47.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  22.64 
 
 		 1104 aa  45.8  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>