35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2890 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4099  phage tape measure protein  100 
 
 		 1137 aa  2233    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2890  phage tape measure protein  100 
 
 		 1137 aa  2233    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1030  bacteriophage tail tape meausure protein  48.85 
 
 		 1282 aa  194  9e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.519663 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0280  phage tape measure protein  41.6 
 
 		 530 aa  176  2.9999999999999996e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  36.36 
 
 		 1366 aa  174  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  35.17 
 
 		 1343 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  32.84 
 
 		 1318 aa  157  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4710  phage tape measure protein  33.44 
 
 		 513 aa  151  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  32.33 
 
 		 1095 aa  141  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  36.4 
 
 		 1380 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  36.53 
 
 		 1354 aa  126  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  35.78 
 
 		 1366 aa  125  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0657  gp21  39.68 
 
 		 1056 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  37.61 
 
 		 1644 aa  118  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  31.5 
 
 		 1080 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  28.74 
 
 		 1451 aa  117  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  33.02 
 
 		 1075 aa  115  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  31.1 
 
 		 1080 aa  108  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  31.1 
 
 		 1080 aa  108  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  31.1 
 
 		 1080 aa  108  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2489  phage tape measure protein  37.44 
 
 		 1527 aa  107  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  40.59 
 
 		 1222 aa  104  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  30.22 
 
 		 1251 aa  101  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  29.64 
 
 		 991 aa  97.4  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3596  phage tape measure protein  30.19 
 
 		 632 aa  87  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0625908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  25.66 
 
 		 671 aa  82.4  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  25.77 
 
 		 668 aa  79  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2488  phage tape measure protein  34.62 
 
 		 611 aa  79.3  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1441  phage tape measure protein  32.12 
 
 		 706 aa  76.3  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2248  TP901 family phage tail tape measure protein  38.93 
 
 		 914 aa  73.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.678247  hitchhiker  0.00399711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  26.55 
 
 		 915 aa  72.4  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  28.71 
 
 		 760 aa  70.1  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  26.67 
 
 		 921 aa  57  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0788  phage tape measure protein  19.63 
 
 		 866 aa  55.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1643  phage tape measure protein  31.79 
 
 		 938 aa  44.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>