83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2225 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  100 
 
 		 1095 aa  2201    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  39.81 
 
 		 1080 aa  602  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  39.86 
 
 		 1075 aa  581  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  39.77 
 
 		 1080 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  39.68 
 
 		 1080 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  39.81 
 
 		 1080 aa  572  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  34.8 
 
 		 1343 aa  191  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  33.23 
 
 		 1318 aa  177  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  35.71 
 
 		 1366 aa  172  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4710  phage tape measure protein  34.89 
 
 		 513 aa  164  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0280  phage tape measure protein  33.2 
 
 		 530 aa  150  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1030  bacteriophage tail tape meausure protein  34.36 
 
 		 1282 aa  146  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.519663 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  31.43 
 
 		 1380 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1366 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  30.6 
 
 		 1354 aa  139  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  30.18 
 
 		 1063 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0657  gp21  35.2 
 
 		 1056 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  38.14 
 
 		 1251 aa  130  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  29.83 
 
 		 1031 aa  129  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1416  gifsy-1 prophage VmtH  32.88 
 
 		 1028 aa  129  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.312107  hitchhiker  0.00396593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  29.44 
 
 		 1028 aa  129  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0703  gifsy-1 prophage VmtH  29.61 
 
 		 1031 aa  127  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  28.57 
 
 		 991 aa  126  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1079  gifsy-1 prophage VmtH  33.56 
 
 		 1028 aa  126  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.497302  normal  0.0993737 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2780  Phage tail tape measure protein lambda  29.48 
 
 		 1161 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0242921 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  29.73 
 
 		 1644 aa  121  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2890  phage tape measure protein  33.96 
 
 		 1137 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4099  phage tape measure protein  33.96 
 
 		 1137 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245804 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  25.98 
 
 		 1021 aa  115  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  27.48 
 
 		 668 aa  110  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2489  phage tape measure protein  30 
 
 		 1527 aa  109  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  27.11 
 
 		 915 aa  108  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  27.15 
 
 		 671 aa  108  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08240  hypothetical protein  30.62 
 
 		 611 aa  103  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0780  hypothetical protein  29.46 
 
 		 612 aa  99.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  26.61 
 
 		 921 aa  97.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  27.93 
 
 		 1104 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  34.25 
 
 		 1222 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  27.82 
 
 		 1451 aa  92.8  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3596  phage tape measure protein  28.77 
 
 		 632 aa  87.8  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0625908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  27.32 
 
 		 1122 aa  87  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  28.75 
 
 		 914 aa  82  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1643  phage tape measure protein  50 
 
 		 938 aa  80.9  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  28.07 
 
 		 760 aa  75.1  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1441  phage tape measure protein  21.13 
 
 		 706 aa  67.4  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1986  gene transfer agent (GTA) orfg11  63.27 
 
 		 188 aa  67.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.526673 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2167  hypothetical protein  42.86 
 
 		 222 aa  66.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  25.35 
 
 		 857 aa  65.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  26.4 
 
 		 881 aa  65.5  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1349  hypothetical protein  48.78 
 
 		 199 aa  64.3  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.0000819599  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4975  gene transfer agent (GTA) orfg11  57.89 
 
 		 192 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  hitchhiker  0.000111577 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  26.09 
 
 		 870 aa  64.3  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  25.73 
 
 		 859 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  25.73 
 
 		 859 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1068  phage-related minor tail protein-like  50 
 
 		 219 aa  63.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.136113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  25.73 
 
 		 881 aa  62.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  26.34 
 
 		 881 aa  62.4  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  26.34 
 
 		 881 aa  62.4  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1820  gene transfer agent (GTA) like protein  58.33 
 
 		 195 aa  62.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.353645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1177  gene transfer agent (GTA) like protein  40.82 
 
 		 194 aa  62.4  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2488  phage tape measure protein  24.12 
 
 		 611 aa  61.6  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3462  gene transfer agent (GTA) orfg11  56.25 
 
 		 196 aa  59.7  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.251991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1642  Phage-related minor tail protein-like  53.57 
 
 		 222 aa  59.3  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1085  hypothetical protein  53.23 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0521861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2112  gene transfer agent (GTA) like protein  55.32 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631991  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1140  putative phage tail minor protein  50 
 
 		 216 aa  56.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.594391 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2891  phage-related minor tail protein-like  30.73 
 
 		 223 aa  55.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402699  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0915  phage-related minor tail protein-like protein  38.35 
 
 		 205 aa  54.3  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962484 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2475  putative phage tail minor protein  48.39 
 
 		 206 aa  54.3  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0334459  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1418  gene transfer agent (GTA) orfg11  50.88 
 
 		 208 aa  54.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303639  normal  0.105083 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  23.99 
 
 		 853 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1422  gene transfer agent (GTA) like protein  40.22 
 
 		 194 aa  53.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  23.99 
 
 		 853 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  23.99 
 
 		 853 aa  52.4  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3164  gene transfer agent (GTA) orfg11  47.46 
 
 		 190 aa  52.4  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939369  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1349  lambda family phage tail tape measure protein  26.09 
 
 		 853 aa  52  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.179371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1422  gene transfer agent (GTA) orfg11  59.09 
 
 		 208 aa  52  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0992875  normal  0.120159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1696  gene transfer agent (GTA) orfg11  59.09 
 
 		 208 aa  52  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0597  hypothetical protein  53.19 
 
 		 189 aa  50.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0597  hypothetical protein  53.19 
 
 		 181 aa  50.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4676  hypothetical protein  44.78 
 
 		 1609 aa  46.6  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2235  prophage tail length tape measure  47.17 
 
 		 1113 aa  45.8  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  21.89 
 
 		 908 aa  45.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>