36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0657 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0657  gp21  100 
 
 		 1056 aa  2102    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011896 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  29.28 
 
 		 1080 aa  174  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  31.91 
 
 		 1080 aa  164  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  31.16 
 
 		 1080 aa  164  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  31.16 
 
 		 1080 aa  164  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  32.63 
 
 		 1075 aa  159  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  28.18 
 
 		 1095 aa  149  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  35.23 
 
 		 1318 aa  147  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  35.21 
 
 		 1343 aa  146  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  33.23 
 
 		 1366 aa  144  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4710  phage tape measure protein  34.75 
 
 		 513 aa  144  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0280  phage tape measure protein  33.75 
 
 		 530 aa  137  9.999999999999999e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1030  bacteriophage tail tape meausure protein  35.02 
 
 		 1282 aa  127  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.519663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  30.42 
 
 		 1644 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  31.03 
 
 		 1380 aa  115  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  30.08 
 
 		 1451 aa  110  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  33.08 
 
 		 1251 aa  110  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1354 aa  107  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2890  phage tape measure protein  39.58 
 
 		 1137 aa  106  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4099  phage tape measure protein  39.58 
 
 		 1137 aa  106  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245804 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1366 aa  105  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  34.93 
 
 		 1222 aa  103  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  28.38 
 
 		 915 aa  101  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  28.36 
 
 		 921 aa  101  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  25.95 
 
 		 991 aa  85.9  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1230  hypothetical protein  32.56 
 
 		 726 aa  82.4  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.909152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  29.47 
 
 		 668 aa  77  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2488  phage tape measure protein  24.39 
 
 		 611 aa  77  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  28.64 
 
 		 671 aa  75.5  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3596  phage tape measure protein  26.6 
 
 		 632 aa  72  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0625908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1441  phage tape measure protein  23.93 
 
 		 706 aa  71.2  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  27.64 
 
 		 760 aa  61.2  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0788  phage tape measure protein  23.15 
 
 		 866 aa  55.5  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  30.65 
 
 		 957 aa  47.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3691  hypothetical protein  43.64 
 
 		 902 aa  45.8  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3933  lambda family phage tail tape measure protein  24.12 
 
 		 1104 aa  45.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>