50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1615 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  94.61 
 
 		 668 aa  1236    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  100 
 
 		 671 aa  1330    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  45.82 
 
 		 921 aa  227  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3596  phage tape measure protein  47.49 
 
 		 632 aa  222  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0625908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  44.59 
 
 		 760 aa  209  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  42.28 
 
 		 915 aa  200  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  38.55 
 
 		 1451 aa  153  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  34.16 
 
 		 1318 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  28.52 
 
 		 1080 aa  110  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  31.71 
 
 		 1343 aa  107  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4710  phage tape measure protein  32.2 
 
 		 513 aa  107  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  26.82 
 
 		 1075 aa  105  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  30.92 
 
 		 1366 aa  105  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  27.24 
 
 		 1080 aa  104  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  27.24 
 
 		 1080 aa  104  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  29.38 
 
 		 1080 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  44.2 
 
 		 794 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  27.24 
 
 		 1644 aa  99  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  27.15 
 
 		 1095 aa  99.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0288  hypothetical protein  41.38 
 
 		 781 aa  97.4  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  34 
 
 		 1251 aa  84  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0280  phage tape measure protein  27.07 
 
 		 530 aa  81.6  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  32.29 
 
 		 1222 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  29.27 
 
 		 1380 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2489  phage tape measure protein  30.77 
 
 		 1527 aa  77.4  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1030  bacteriophage tail tape meausure protein  27.15 
 
 		 1282 aa  76.6  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.519663 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0657  gp21  28.64 
 
 		 1056 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011896 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  38.85 
 
 		 701 aa  69.7  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0634  hypothetical protein  55.38 
 
 		 691 aa  68.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.486011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1354 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1366 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2414  hypothetical protein  52.11 
 
 		 957 aa  65.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2890  phage tape measure protein  24.27 
 
 		 1137 aa  61.6  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4099  phage tape measure protein  24.27 
 
 		 1137 aa  61.6  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245804 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1441  phage tape measure protein  25.19 
 
 		 706 aa  58.5  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2488  phage tape measure protein  30.77 
 
 		 611 aa  55.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2994  hypothetical protein  34.68 
 
 		 717 aa  53.9  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0274  hypothetical protein  29.79 
 
 		 419 aa  53.5  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  22.18 
 
 		 991 aa  53.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2485  hypothetical protein  28.29 
 
 		 851 aa  52.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.652813  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3962  hypothetical protein  36.63 
 
 		 671 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.443491 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0929  hypothetical protein  38.37 
 
 		 174 aa  47.8  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.333514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1880  hypothetical protein  54.05 
 
 		 698 aa  47.4  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.384763 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3161  hypothetical protein  26.11 
 
 		 828 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0780  hypothetical protein  25.13 
 
 		 612 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08240  hypothetical protein  25.13 
 
 		 611 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  32.53 
 
 		 1122 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  53.49 
 
 		 957 aa  45.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1741  hypothetical protein  60.71 
 
 		 486 aa  44.3  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.391392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3387  hypothetical protein  38.89 
 
 		 715 aa  43.9  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000202252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>