35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1441 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1441  phage tape measure protein  100 
 
 		 706 aa  1406    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2488  phage tape measure protein  43.2 
 
 		 611 aa  234  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0788  phage tape measure protein  28.57 
 
 		 866 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2955  hypothetical protein  27.17 
 
 		 712 aa  151  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2675  phage tape measure protein  32.64 
 
 		 1644 aa  103  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4710  phage tape measure protein  29.35 
 
 		 513 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.262419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  30.77 
 
 		 1318 aa  101  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0280  phage tape measure protein  22.94 
 
 		 530 aa  99  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  28.17 
 
 		 1343 aa  99  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  33.33 
 
 		 1366 aa  90.9  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1198  lambda family phage tail tape measure protein  25.76 
 
 		 1075 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2237  tail length tape measure protein  25.67 
 
 		 1080 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550584 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0657  gp21  25.42 
 
 		 1056 aa  72.4  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000011896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4084  lambda family phage tail tape measure protein  30.73 
 
 		 1251 aa  72.4  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.622569  normal  0.0282318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2489  phage tape measure protein  43.18 
 
 		 1527 aa  71.6  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2173  tail length tape measure protein  28.8 
 
 		 1080 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0499654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1549  tail length tape measure protein  28.8 
 
 		 1080 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0203252  hitchhiker  0.00310541 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1030  bacteriophage tail tape meausure protein  36.19 
 
 		 1282 aa  69.7  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.519663 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2883  tail length tape measure protein  28.8 
 
 		 1080 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541295 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3596  phage tape measure protein  33.05 
 
 		 632 aa  68.6  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0625908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1366 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1354 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1000  phage tape measure protein  24.39 
 
 		 991 aa  65.1  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  27.14 
 
 		 1380 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  27.5 
 
 		 1451 aa  64.3  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4099  phage tape measure protein  36.26 
 
 		 1137 aa  64.3  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2890  phage tape measure protein  36.26 
 
 		 1137 aa  64.3  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2225  lambda family phage tail tape measure protein  30.39 
 
 		 1095 aa  62.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1321  phage tape measure protein  33.8 
 
 		 760 aa  61.6  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1615  hypothetical protein  25.19 
 
 		 671 aa  58.5  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.545679 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1471  hypothetical protein  24.81 
 
 		 668 aa  57.8  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  25 
 
 		 915 aa  54.3  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  29.57 
 
 		 921 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  28.44 
 
 		 1222 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3355  putative tape measure protein  23.33 
 
 		 775 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>