24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2477 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2477  hypothetical protein  100 
 
 		 732 aa  1473    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3992  hypothetical protein  53.71 
 
 		 738 aa  761    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  45.24 
 
 		 811 aa  99  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  34.59 
 
 		 924 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  35.18 
 
 		 936 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2008  hypothetical protein  26.38 
 
 		 735 aa  81.6  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.904662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7316  hypothetical protein  30.58 
 
 		 674 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198357  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2177  hypothetical protein  52.86 
 
 		 620 aa  73.9  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502286 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1716  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  48.19 
 
 		 924 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.309525  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  57.14 
 
 		 970 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1127 aa  68.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3346  hypothetical protein  39.1 
 
 		 682 aa  64.7  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.677729  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  25.98 
 
 		 669 aa  63.9  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1606  hypothetical protein  30.86 
 
 		 682 aa  63.9  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2089  hypothetical protein  62.75 
 
 		 735 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  61.11 
 
 		 1380 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1311  hypothetical protein  62.75 
 
 		 735 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  37.67 
 
 		 1366 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  37.67 
 
 		 1354 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  58.97 
 
 		 1173 aa  49.3  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  33.82 
 
 		 1096 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3197  phage tape measure protein  37.33 
 
 		 1318 aa  48.5  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  34.83 
 
 		 1343 aa  47.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  37.14 
 
 		 1366 aa  44.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>