20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2177 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2177  hypothetical protein  100 
 
 		 620 aa  1231    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2477  hypothetical protein  52.86 
 
 		 732 aa  73.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3992  hypothetical protein  50 
 
 		 738 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  33.6 
 
 		 970 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  58.18 
 
 		 924 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  60 
 
 		 811 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  63.04 
 
 		 1380 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0550  TP901 family phage tail tape measure protein  32.54 
 
 		 969 aa  55.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  49.38 
 
 		 936 aa  53.9  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1716  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  49.33 
 
 		 924 aa  53.9  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.309525  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  58.82 
 
 		 1354 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  58.82 
 
 		 1366 aa  52.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2089  hypothetical protein  50 
 
 		 735 aa  50.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1311  hypothetical protein  50 
 
 		 735 aa  50.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  61.11 
 
 		 1127 aa  49.7  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  30.58 
 
 		 1173 aa  48.9  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1631  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1304 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0628318  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0873  putative bacteriophage-related transmembrane protein  36.11 
 
 		 1366 aa  46.6  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00870949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2178  phage tail tape measure protein, TP901 family  36.36 
 
 		 1342 aa  46.2  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1924  hypothetical protein  27.18 
 
 		 693 aa  44.3  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>