31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1311 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2089  hypothetical protein  100 
 
 		 735 aa  1440    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1311  hypothetical protein  100 
 
 		 735 aa  1440    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1517  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  39.1 
 
 		 924 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.813512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3992  hypothetical protein  36.77 
 
 		 738 aa  77.4  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2477  hypothetical protein  53.57 
 
 		 732 aa  77  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2177  hypothetical protein  50 
 
 		 620 aa  73.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1880  hypothetical protein  49.37 
 
 		 698 aa  69.7  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.384763 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  33.33 
 
 		 783 aa  66.6  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  30.53 
 
 		 794 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1638  putative tail component of prophage CP-933K  32.8 
 
 		 936 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663672  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  40 
 
 		 970 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  34.02 
 
 		 914 aa  57.8  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  59.52 
 
 		 1127 aa  57.8  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1884  hypothetical protein  55 
 
 		 811 aa  56.6  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.505665  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3876  phage tape measure protein  59.18 
 
 		 1380 aa  55.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147169 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3368  hypothetical protein  30.47 
 
 		 1724 aa  54.3  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7316  hypothetical protein  29.66 
 
 		 674 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198357  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  29.29 
 
 		 1122 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1716  putative phage HK97 tail length tape measure-related protein  44.62 
 
 		 924 aa  50.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.309525  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3791  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1724 aa  50.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2414  hypothetical protein  32.17 
 
 		 957 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1056  hypothetical protein  62 
 
 		 1366 aa  49.7  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414557  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2994  hypothetical protein  34.91 
 
 		 717 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1688  hypothetical protein  62 
 
 		 1354 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2235  prophage tail length tape measure  45.16 
 
 		 1113 aa  48.9  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0994  phage tail tape measure protein, TP901 family  65.71 
 
 		 1173 aa  48.9  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0274  hypothetical protein  27.11 
 
 		 419 aa  47.4  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1032 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2008  hypothetical protein  28.15 
 
 		 735 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.904662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  30.3 
 
 		 1285 aa  47  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1032 aa  43.9  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>