20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3368 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2059  phage tail tape measure protein  83.93 
 
 		 1673 aa  1828    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3368  hypothetical protein  100 
 
 		 1724 aa  3373    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3328  hypothetical protein  80.56 
 
 		 1632 aa  1789    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.053568 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3791  hypothetical protein  95.48 
 
 		 1724 aa  3021    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1636  lambda family phage tail tape measure protein  82.99 
 
 		 1668 aa  1783    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1657  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1508 aa  205  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  28.94 
 
 		 1906 aa  160  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  32.37 
 
 		 1835 aa  157  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0819  tape measure domain-containing protein  30.18 
 
 		 1451 aa  142  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.060992  normal  0.0141632 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1180  Prophage tail length tape measure  22.05 
 
 		 1707 aa  71.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.537045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1331  hypothetical protein  58.33 
 
 		 1655 aa  67.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  31.8 
 
 		 968 aa  64.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1311  hypothetical protein  29.69 
 
 		 735 aa  53.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2089  hypothetical protein  29.69 
 
 		 735 aa  53.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1263 aa  53.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1611  hypothetical protein  33.82 
 
 		 1507 aa  52.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  32.85 
 
 		 1353 aa  52.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3255  prophage tail length tape measure  31.39 
 
 		 1555 aa  48.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0755523  decreased coverage  0.000000000000332378 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1230  hypothetical protein  36.79 
 
 		 726 aa  48.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.909152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1127 aa  47.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>