62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5056 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  42.28 
 
 		 1160 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  67.17 
 
 		 1263 aa  1494    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  58.98 
 
 		 1192 aa  1053    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  49.86 
 
 		 1248 aa  928    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  100 
 
 		 1353 aa  2684    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  59.48 
 
 		 1190 aa  1105    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  47.7 
 
 		 1203 aa  917    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  31.38 
 
 		 1096 aa  324  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0293  hypothetical protein  36.54 
 
 		 1164 aa  283  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0797  phage-related minor tail protein  35.82 
 
 		 1115 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3717  hypothetical protein  30.11 
 
 		 1127 aa  177  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.417403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  33.97 
 
 		 1032 aa  161  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  32.23 
 
 		 1032 aa  161  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2989  hypothetical protein  34.96 
 
 		 1268 aa  142  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.977913  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1587  Lytic transglycosylase catalytic  38.72 
 
 		 1285 aa  108  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2351  hypothetical protein  35.9 
 
 		 669 aa  102  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  43.36 
 
 		 783 aa  102  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5700  hypothetical protein  30.6 
 
 		 457 aa  99.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  38.73 
 
 		 255 aa  94.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  37.14 
 
 		 237 aa  94.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1990  tail component of prophage protein  42.14 
 
 		 915 aa  94.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  37.09 
 
 		 671 aa  93.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1761  phage tape measure protein  36.17 
 
 		 921 aa  90.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.337369 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  33.03 
 
 		 871 aa  89.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4241  hypothetical protein  45.71 
 
 		 139 aa  87.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1371  hypothetical protein  37.06 
 
 		 794 aa  77.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0885  minor tail protein H  36.29 
 
 		 870 aa  77  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2953  prophage LambdaSo, tail length tape meausure protein  23.96 
 
 		 914 aa  76.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3126  putative prophage tail length tape measure protein  36.48 
 
 		 881 aa  75.1  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0141545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2768  putative prophage tail length tape measure protein  36.52 
 
 		 859 aa  73.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1195  putative prophage tail length tape measure protein  36.52 
 
 		 859 aa  73.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3396  lambda family phage tail tape measure protein  31.94 
 
 		 908 aa  73.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799108  hitchhiker  0.00000000000741098 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1796  putative prophage tail length tape measure protein  36.17 
 
 		 881 aa  72.8  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132418 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0372  hypothetical protein  34.4 
 
 		 968 aa  72.4  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1872  putative prophage tail length tape measure protein  34.68 
 
 		 881 aa  71.6  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179958 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3194  putative prophage tail length tape measure protein  34.68 
 
 		 881 aa  71.6  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1467  tail length tape measure protein  32.24 
 
 		 857 aa  69.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2104  lambda family phage tail tape measure protein  36.42 
 
 		 853 aa  67.8  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000689811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00745  hypothetical protein  36.42 
 
 		 853 aa  68.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10049  tail component  36.42 
 
 		 853 aa  68.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0873  Methyl-accepting chemotaxis protein  33.51 
 
 		 701 aa  66.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2417  phage tail tape measure protein lambda  28.19 
 
 		 1063 aa  65.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.570693  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1449  TP901 family phage tail tape measure protein  46.38 
 
 		 1120 aa  64.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1633  putative prophage tail length tape measure protein  36.8 
 
 		 849 aa  63.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2200  prophage tail length tape measure protein, putative  36.9 
 
 		 1167 aa  63.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  29.35 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1231  hypothetical protein  55.77 
 
 		 647 aa  58.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  41.54 
 
 		 1628 aa  55.5  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1782  prophage tail length tape measure  26.88 
 
 		 1835 aa  55.1  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  27.43 
 
 		 1364 aa  55.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3367  prophage tail length tape measure  21.61 
 
 		 970 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759316 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2583  phage tail tape measure protein, lambda family  35.71 
 
 		 1122 aa  52.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.887267 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3368  hypothetical protein  32.85 
 
 		 1724 aa  52.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0288  hypothetical protein  29.61 
 
 		 781 aa  51.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4046  tail tape measure protein  31.69 
 
 		 1222 aa  49.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374256  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3791  hypothetical protein  31.39 
 
 		 1724 aa  48.5  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1151  gifsy-1 prophage VmtH  27.51 
 
 		 1028 aa  47.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1690  phage hk97 tail length tape measure-related protein  23.58 
 
 		 957 aa  47.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260422  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1628  prophage tail length tape measure  25.37 
 
 		 1906 aa  46.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.937522  normal  0.73173 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0908  putative prophage tail length tape measure protein  24.35 
 
 		 1021 aa  45.1  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1611  hypothetical protein  33.75 
 
 		 1507 aa  45.1  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2801  gifsy-1 prophage VmtH  27.32 
 
 		 1031 aa  45.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.617877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>