42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4086 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  100 
 
 		 1364 aa  2796    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2287  phage internal core protein  24.09 
 
 		 1569 aa  173  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  33.52 
 
 		 290 aa  80.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  34.9 
 
 		 255 aa  72  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  32.89 
 
 		 671 aa  68.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  32.18 
 
 		 1190 aa  68.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  29.32 
 
 		 289 aa  68.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  28.99 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  29.02 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1192 aa  65.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  36.73 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1248 aa  64.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  35.17 
 
 		 871 aa  63.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1203 aa  62.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  33.09 
 
 		 435 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  30.43 
 
 		 783 aa  59.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  29.28 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  27.98 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1263 aa  58.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  27.93 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  29.74 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  28.38 
 
 		 314 aa  56.2  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1353 aa  55.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  28.57 
 
 		 324 aa  55.5  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2720  hypothetical protein  32.59 
 
 		 361 aa  54.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758469  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2292  lytic transglycosylase catalytic  28.33 
 
 		 387 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238503  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 406 aa  53.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  29.09 
 
 		 291 aa  52.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  28.02 
 
 		 339 aa  52.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  25.48 
 
 		 372 aa  52.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  25.48 
 
 		 372 aa  52.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  31.52 
 
 		 1096 aa  52  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  30.25 
 
 		 276 aa  52.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  30.15 
 
 		 372 aa  52  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  30.15 
 
 		 372 aa  51.6  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0316  Lytic transglycosylase catalytic  27.27 
 
 		 372 aa  51.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454669  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2267  hypothetical protein  29.85 
 
 		 370 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  28.08 
 
 		 360 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  25.17 
 
 		 357 aa  50.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  29.8 
 
 		 360 aa  50.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  30.05 
 
 		 638 aa  48.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  24.2 
 
 		 371 aa  47  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>