42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3599 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 406 aa  800    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  53.37 
 
 		 371 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  53.48 
 
 		 372 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  53.48 
 
 		 372 aa  340  4e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2292  lytic transglycosylase catalytic  49.23 
 
 		 387 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238503  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0316  Lytic transglycosylase catalytic  49.2 
 
 		 372 aa  279  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  37.13 
 
 		 360 aa  193  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  44.16 
 
 		 357 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2556  hypothetical protein  45.58 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2779  hypothetical protein  45.58 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5606  hypothetical protein  37.33 
 
 		 388 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2487  hypothetical protein  44.69 
 
 		 377 aa  179  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.867123  normal  0.0497364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  46.08 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  40.74 
 
 		 289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  35.82 
 
 		 339 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  34.15 
 
 		 346 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  34.33 
 
 		 638 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 364 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  41.8 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  31.95 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  35.79 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  39.18 
 
 		 276 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  32.03 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  38.5 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  38.5 
 
 		 372 aa  117  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  38.98 
 
 		 336 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  41.32 
 
 		 291 aa  116  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  33.67 
 
 		 339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  34.21 
 
 		 314 aa  113  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  36.02 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2267  hypothetical protein  37.97 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2720  hypothetical protein  35.44 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758469  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6296  hypothetical protein  38.42 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  30.38 
 
 		 671 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  35.83 
 
 		 871 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  30.66 
 
 		 1364 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  30.53 
 
 		 255 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  31.65 
 
 		 237 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1096 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  44.3  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  38.6 
 
 		 181 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  38.6 
 
 		 181 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>