41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3574 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  586  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  50.77 
 
 		 324 aa  185  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  51.6 
 
 		 314 aa  185  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  48.02 
 
 		 339 aa  185  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  46.7 
 
 		 332 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  47.62 
 
 		 372 aa  178  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  47.62 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  51.03 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  46.58 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  48.9 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  47.69 
 
 		 336 aa  175  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  50.26 
 
 		 346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  46.77 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2267  hypothetical protein  48.42 
 
 		 370 aa  168  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  50.26 
 
 		 377 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  48.09 
 
 		 360 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  44.83 
 
 		 276 aa  145  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6296  hypothetical protein  49.2 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  38.46 
 
 		 360 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  41.3 
 
 		 638 aa  136  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  37.98 
 
 		 357 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2720  hypothetical protein  43.37 
 
 		 361 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758469  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2556  hypothetical protein  36.7 
 
 		 381 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2779  hypothetical protein  36.7 
 
 		 381 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2487  hypothetical protein  36.17 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.867123  normal  0.0497364 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  41.15 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  41.15 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  41.15 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2292  lytic transglycosylase catalytic  42.71 
 
 		 387 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238503  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  42.77 
 
 		 435 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  40.1 
 
 		 371 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5606  hypothetical protein  41.81 
 
 		 388 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0316  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 372 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454669  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  34.78 
 
 		 1364 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  32.46 
 
 		 1096 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  37.29 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 871 aa  62.4  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  30.54 
 
 		 783 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  36.92 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  31.21 
 
 		 255 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1203 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>