41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3051 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  847    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  52.94 
 
 		 360 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  60.27 
 
 		 357 aa  259  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2487  hypothetical protein  58.55 
 
 		 377 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.867123  normal  0.0497364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2779  hypothetical protein  57.98 
 
 		 381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2556  hypothetical protein  57.98 
 
 		 381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5606  hypothetical protein  58.77 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  43.8 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  44.24 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  43.78 
 
 		 372 aa  179  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  46.08 
 
 		 406 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2292  lytic transglycosylase catalytic  39.91 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238503  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0316  Lytic transglycosylase catalytic  43.52 
 
 		 372 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454669  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  45.18 
 
 		 291 aa  125  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  42.94 
 
 		 360 aa  123  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  42.44 
 
 		 372 aa  123  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  42.44 
 
 		 372 aa  122  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  42.77 
 
 		 290 aa  120  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  41.11 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  40 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  40.11 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  40.68 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  39.55 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2267  hypothetical protein  44.77 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  34.63 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  35.56 
 
 		 364 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2720  hypothetical protein  38.86 
 
 		 361 aa  110  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758469  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  36.26 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  35.75 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  33.78 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  36.72 
 
 		 638 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6296  hypothetical protein  42.78 
 
 		 343 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  36.45 
 
 		 276 aa  91.3  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  33.09 
 
 		 1364 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  35.29 
 
 		 237 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  33.99 
 
 		 871 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1096 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  30.06 
 
 		 255 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  31.53 
 
 		 274 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  34.09 
 
 		 783 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2447  hypothetical protein  35.94 
 
 		 718 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197244  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>