43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5181 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  669    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  60.59 
 
 		 324 aa  355  7.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  56.22 
 
 		 377 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  56.99 
 
 		 364 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  58.64 
 
 		 339 aa  331  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  57.1 
 
 		 314 aa  330  3e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  55.75 
 
 		 346 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  55.28 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  53.65 
 
 		 372 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  54.55 
 
 		 372 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  48.99 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2267  hypothetical protein  55.08 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  52.46 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  51.08 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6296  hypothetical protein  54.84 
 
 		 343 aa  179  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  49.73 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  48.02 
 
 		 290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  45.6 
 
 		 276 aa  149  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  40.53 
 
 		 638 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2779  hypothetical protein  34.75 
 
 		 381 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2556  hypothetical protein  34.75 
 
 		 381 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  39.71 
 
 		 357 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2487  hypothetical protein  34.88 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.867123  normal  0.0497364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  38.28 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  35.82 
 
 		 406 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2292  lytic transglycosylase catalytic  37.19 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238503  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2720  hypothetical protein  40.64 
 
 		 361 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758469  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 		 371 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5606  hypothetical protein  35.21 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  34.63 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0316  Lytic transglycosylase catalytic  35.64 
 
 		 372 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454669  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  31.89 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  35.66 
 
 		 871 aa  62.8  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  31.79 
 
 		 1096 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  27.46 
 
 		 1364 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  31.82 
 
 		 783 aa  56.2  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  31.76 
 
 		 671 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2447  hypothetical protein  31.82 
 
 		 718 aa  52.8  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  33.08 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  30.4 
 
 		 274 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5700  hypothetical protein  38.33 
 
 		 457 aa  42.7  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>