41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1659 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  77.4 
 
 		 314 aa  484  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  65.3 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  61.18 
 
 		 339 aa  361  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  62.1 
 
 		 364 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3869  hypothetical protein  61.54 
 
 		 346 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  57.02 
 
 		 377 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  46.91 
 
 		 336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  55.85 
 
 		 372 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  43.42 
 
 		 372 aa  205  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  44.6 
 
 		 360 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  47.49 
 
 		 332 aa  192  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2267  hypothetical protein  44.77 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.325406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6296  hypothetical protein  56.99 
 
 		 343 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  52.46 
 
 		 291 aa  172  9e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  50.77 
 
 		 290 aa  169  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  45.7 
 
 		 289 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  38.21 
 
 		 638 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  43 
 
 		 276 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  39.47 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2720  hypothetical protein  40.87 
 
 		 361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758469  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2556  hypothetical protein  40.23 
 
 		 381 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2779  hypothetical protein  40.23 
 
 		 381 aa  125  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  36.46 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  36.46 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  37.89 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2487  hypothetical protein  39.33 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.867123  normal  0.0497364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  35.79 
 
 		 371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  35.79 
 
 		 406 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2292  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 387 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238503  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5606  hypothetical protein  40.23 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  40.68 
 
 		 435 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0316  Lytic transglycosylase catalytic  38.95 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454669  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  33.54 
 
 		 1096 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  28.57 
 
 		 1364 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  36.13 
 
 		 871 aa  52.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  33.07 
 
 		 255 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  31.03 
 
 		 237 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2447  hypothetical protein  27.85 
 
 		 718 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  29.37 
 
 		 671 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  29.37 
 
 		 274 aa  42.7  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>