47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3764 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3764  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  553  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0811492  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3074  hypothetical protein  45.86 
 
 		 237 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3770  hypothetical protein  40.28 
 
 		 871 aa  112  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.591886  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5677  hypothetical protein  38.89 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0251  hypothetical protein  37.5 
 
 		 783 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1269  hypothetical protein  97.44 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1041  hypothetical protein  94.74 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5452  hypothetical protein  36.44 
 
 		 1096 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1153  hypothetical protein  35 
 
 		 671 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3574  hypothetical protein  35.94 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3873  Prophage tail length tape measure  30.32 
 
 		 1190 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.598655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5056  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1353 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4067  hypothetical protein  30 
 
 		 1263 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5758  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1192 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2603  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1032 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4292  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1032 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.599017  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2447  hypothetical protein  35.05 
 
 		 718 aa  55.8  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7016  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1203 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5181  hypothetical protein  31.72 
 
 		 339 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0268  hypothetical protein  33.88 
 
 		 360 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2556  hypothetical protein  32.82 
 
 		 381 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2779  hypothetical protein  32.82 
 
 		 381 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2487  hypothetical protein  33.83 
 
 		 377 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.867123  normal  0.0497364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5606  hypothetical protein  34.04 
 
 		 388 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.545793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7204  hypothetical protein  33.61 
 
 		 336 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2688  hypothetical protein  32.41 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1258  hypothetical protein  35.82 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6230  hypothetical protein  30.89 
 
 		 1248 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3051  hypothetical protein  31.78 
 
 		 435 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0638  hypothetical protein  33.97 
 
 		 638 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3244  hypothetical protein  30.65 
 
 		 364 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.262677  normal  0.336955 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1844  hypothetical protein  30.51 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2678  lytic transglycosylase catalytic  34.11 
 
 		 372 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2905  Lytic transglycosylase catalytic  34.11 
 
 		 372 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2186  hypothetical protein  30.53 
 
 		 377 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0774004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3111  hypothetical protein  30.46 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4086  Transglycosylase domain protein  25.6 
 
 		 1364 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1331  hypothetical protein  30.53 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5198  hypothetical protein  34.45 
 
 		 357 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0902474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4453  hypothetical protein  30.23 
 
 		 360 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.01877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6296  hypothetical protein  34.43 
 
 		 343 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2585  hypothetical protein  30.89 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2310  hypothetical protein  30.89 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0151599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1659  hypothetical protein  29.77 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3599  lytic transglycosylase catalytic  34.19 
 
 		 406 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515044 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2904  lytic transglycosylase, catalytic  33.88 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2800  Lytic transglycosylase catalytic  30.06 
 
 		 371 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>